当前解析结果
SmilChr04G000412| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000412 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000412 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000412 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 4292404 - 4295374 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022301 |
|---|---|
| GeneID | 131022301 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022301 |
| 原始查询 | LOC131022301 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0590366- identity=25.1; qcov=1.04; evalue=3.15e-14; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022301 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807730.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807730.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057807730.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057807730.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057807730.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:4294054 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C78 |
Chr4:4294561 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:4294570 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr4:4294580 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B40 |
Chr4:4294580 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr4:4294590 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B3,C24,C46 |
Chr4:4294630 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B111,B127,B37,C65 |
Chr4:4294653 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B88,C46 |
Chr4:4294671 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B73,B79,C48,C86 |
Chr4:4294683 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr4:4294704 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr4:4294734 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C36,C77,D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。