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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000421`

染色体: Chr04 坐标: 4474611-4480073 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000421`
名称	SmilChr04G000421
描述	protein OBERON 4
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4474611 - 4480073 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022307`
GeneID	`131022307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022307`
原始查询	`LOC131022307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OBERON 4
产物	protein OBERON 4
Arabidopsis	`AT3G63500` (TTA2) fibronectin type III domain protein (DUF1423) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825525] identity=47.5; qcov=0.623; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0239200` (TTA) - identity=42.7; qcov=0.396; evalue=5.03e-116; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF07227 (PHD_Oberon); PF16312 (Oberon_cc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807738.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807738.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807738.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807738.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807738.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4475567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:4475597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:4475989`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A10,A14,A16,A3,A6,B1,B100,B109,B111,B126,B36,B45,B65,B7,B80,B83,B87,B91,B97,B99,C11,C16,C20,C22,C40,C50,C59,C62,C70,C81,C86,D3,D5
`Chr4:4476241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B31,B82,C2,C65
`Chr4:4476274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A18,B28,B60,C62
`Chr4:4476297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B28,B52
`Chr4:4476502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C40
`Chr4:4476820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr4:4476835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B120,B62,B98,D11
`Chr4:4476899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B132
`Chr4:4477508`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	A18
`Chr4:4477508`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807738.1

1158 aa

579

1158

PHD_Oberon

Oberon_cc

PF07227 PHD_Oberon 803-926 aa PF16312 Oberon_cc 1046-1146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807738.1`	Pfam	`PF07227`	PHD_Oberon	Family	803	926	8.2e-39	133.2	PHD - plant homeodomain finger protein
`XP_057807738.1`	Pfam	`PF16312`	Oberon_cc	Coiled-coil	1046	1146	8.3e-38	129.9	Coiled-coil region of Oberon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951755.1
GCGCACTACGCACCCCCTCCCCCACCAGATTGTTTACACTTCCCAAAGCCTTGACCGGTGCGCTATGCGCACTTTGCGTATTCAAGTCTTCATCTTTCTCCCAACCCAACCCCACTACTTTAAAAATTTCCGTTGACTGTATACAAAGCAAATCCCAACTCCAACCTACATATGCAAATCCCCCACGCGCCGCTTTACTCTCCGGCGACCCACGTTTGAATCTGGGTTTGGTTCTACCTAAAGCTTCGACTTTTGTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022307
ATGAAGAGGTTGAGGTCCAGTGATGATCTGCACTCGTACGGGGAGAAGGGTGTTCTGAAGGATTGGGGAAGAAGAGAAGATGAGGCTGCTCCCCAGCGTTCATCTTCGTCTTTGCATAGGAGCTCTTACTACAGATCATCTGATAGTGGGAGGAAGGTCTTATCCTCATCAACATCTAGGTATGATCGGTTAGAAGATGAGAGGGAGAGCTCAAAATTGATTAGGAAGCGGCCGGATTATGATTTGGAGAATTATGATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807738.1
MKRLRSSDDLHSYGEKGVLKDWGRREDEAAPQRSSSSLHRSSYYRSSDSGRKVLSSSTSRYDRLEDERESSKLIRKRPDYDLENYDRRKSYDRHKDGNGNGNGNDRGILSSSPRAGYGMDQMYRSQSFSAPRRDFPKGFRSERDRPKREGIGASWRRFGSGKDADDGARSGSEASRGTRVESKEVGKAKSPQGFRDAKSPAWSKDSGSERSRSVECKKSEEMQVESGGPSSEREEGELEPDPQPDVPAVKPVIEDKAAID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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