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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000424`

染色体: Chr04 坐标: 4496291-4500284 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000424`
名称	SmilChr04G000424
描述	dnaJ protein ERDJ3A
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4496291 - 4500284 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022311`
GeneID	`131022311`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022311`
原始查询	`LOC131022311`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dnaJ protein ERDJ3A
产物	dnaJ protein ERDJ3A
Arabidopsis	`AT3G08970` (ATERDJ3A) DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820049] identity=57.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0293000` (OsERdj3A) - identity=51.3; qcov=0.888; evalue=2.39e-163; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022311

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057807740.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	1.00000	`XP_057807740.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807740.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807740.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807740.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4496655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B42,B43,B58
`Chr4:4496808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C10
`Chr4:4496808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:4497092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:4497649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr4:4497781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:4498203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B35,C20
`Chr4:4498358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C84,D11
`Chr4:4498416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B35,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807740.1

564 aa

282

564

DnaJ

PF00226 DnaJ 26-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807740.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	26	87	9.3e-26	90.4	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951757.1
CTCTTGAATCCTATTGGCTGAGAGCTCGTGGCGGCATTCAGCGAGTGCCACGTCAGCGAAGAGGCCGAACAATCTGGATTTTTCCCCTCCCCTCCCGCAACCTATTAATTCTGGGGCCCCTCACCATCCATAAAACTCCTAAATTTTGAATTTTTTTTTGATGAAGTGAAACTCGTTGTTGGTTGCAAGAATTTGAGGAACAAAACATGAAGAACCGATTCGCATTACCGCTGATTGCCGCCGGAATTATGTTTCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022311
ATGAAGAACCGATTCGCATTACCGCTGATTGCCGCCGGAATTATGTTTCTTCTCTGCGTAGAATCCAAGAAAACCGACCCCTATAAGGTGCTTGGGGTTGATCGAAATGCGTGTAACCGAGAAATTCAGAAAGCCTTTCACAAGTTATCTCTGCAATATCATCCTGACAAAAACAAGAATAAGGGTGCCCAAGAAAAATTTGCAGAGATCAATAATGCATATGACATCTTATCTGATGAGCAGAAAAGAAAGAATTATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807740.1
MKNRFALPLIAAGIMFLLCVESKKTDPYKVLGVDRNACNREIQKAFHKLSLQYHPDKNKNKGAQEKFAEINNAYDILSDEQKRKNYDLYGDEKGNPGFDAGDPRQQGGYSYFTSGGPGQSGFSFTPGDWQNMGGQEGSKSFSFSFGGPGSGGGFDMGDIFSNFFGGGMGGGSQFGGFGSSGRSKQGNRQSSKSIPSVNSQLYRKEIVDKGMTWLLLVHSSNIQEIQIYESVIEEVGNSLLGALKVGSINCGSETSLCKEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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