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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000434`

染色体: Chr04 坐标: 4606390-4609807 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000434`
名称	SmilChr04G000434
描述	monothiol glutaredoxin-S15, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4606390 - 4609807 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022321`
GeneID	`131022321`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022321`
原始查询	`LOC131022321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	monothiol glutaredoxin-S15, mitochondrial
产物	monothiol glutaredoxin-S15%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G15660` (GRX4) glutaredoxin 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820809] identity=71.6; qcov=0.982; evalue=7.6e-79; confidence=high
Rice	`Os01g0530400` (OsGRX5) - identity=56.3; qcov=1.11; evalue=1.11e-66; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00462 (Glutaredoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022321

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057807751.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057807752.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057807751.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807752.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807752.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4606828`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	83	A1,A10,A13,A14,A19,A2,A20,A22,A25,A3,A5,A6,A7,B10,B102,B110,B112,B120,B124,B126,B132,B133,B137,B15,B16,B18,B26,B29,B38,B39,B41,B46,B47,B48,B5,B55,B57,B6,B60,B61,B69,B72,B79,B8,B82,B86,B98,B99,C1,C13,C15,C17,C19,C21,C29,C3,C31,C32,C36,C38,C4,C40,C41,C47,C5,C50,C51,C53,C54,C59,C6,C63,C68,C7,C70,C73,C8,C80,D10,D2,D3,D6,D7
`Chr4:4607501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B26,B29,B95,C71
`Chr4:4607506`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B91,C50
`Chr4:4607506`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B91,C50
`Chr4:4607515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr4:4608003`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	104	A1,A14,A18,A22,A5,A7,A8,B1,B10,B100,B103,B104,B105,B107,B109,B11,B113,B114,B117,B119,B120,B121,B127,B130,B132,B133,B138,B140,B15,B16,B2,B21,B24,B27,B28,B30,B31,B33,B35,B36,B37,B44,B45,B47,B48,B49,B50,B55,B57,B60,B62,B67,B69,B73,B78,B8,B83,B87,B9,B90,B91,B94,B98,C10,C11,C15,C16,C17,C2,C21,C24,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C49,C50,C52,C53,C56,C6,C60,C61,C62,C63,C68,C69,C7,C72,C74,C78,C79,C80,C81,C9,D1,D3,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807751.1

195 aa

195

Glutaredoxin

PF00462 Glutaredoxin 74-138 aa

XP_057807752.1

165 aa

165

Glutaredoxin

PF00462 Glutaredoxin 74-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807751.1`	Pfam	`PF00462`	Glutaredoxin	Domain	74	138	1.2e-18	67.8	Glutaredoxin
`XP_057807752.1`	Pfam	`PF00462`	Glutaredoxin	Domain	74	138	8.4e-19	68.3	Glutaredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951769.1
AAATAAATTCTTCTACTTGGTAGCCCAACAGCAGAAAAGCTCAACCCAACTCCTCTTTCTCTCTCCTTCACATCTCTCCCACATACACAACTCATCTTCCCCCAACTCTTCTGCAACCTCTCCCTCTCACAAATTCACCGCCTCGAACCTCCGGCGAGGTTCCGCCGACAGTCACTGCTGTTGCACAAGCAGCACCGCCACGCCCATCCTTTCTCATCCGACACTCCCCTTTTCCTATCAAATCGGCAAAAACCCGACTC...

XM_057951768.1
TAGCCCAACAGCAGAAAAGCTCAACCCAACTCCTCTTTCTCTCTCCTTCACATCTCTCCCACATACACAACTCATCTTCCCCCAACTCTTCTGCAACCTCTCCCTCTCACAAATTCACCGCCTCGAACCTCCGGCGAGGTTCCGCCGACAGTCACTGCTGTTGCACAAGCAGCACCGCCACGCCCATCCTTTCTCATCCGACACTCCCCTTTTCCTATCAAATCGGCAAAAACCCGACTCTGCAATCCTCTCTCTCTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022321
ATGGCAAGATCTTTATCTAATTTCCTTTACAAAGGCATTGCTGCATTTCCAGCTGCTAGTTCAACTGCATCTGGATCCTTCTATCAGGGCATACATCGTTTTTCCACTTCTGTGCCCAGTGATCCTGATACACATGAAGATTTTAGACCCACGACTAAAGTTGGGAGTTCTGACATGTCCTTGAAGGACATTGTTGAGCAGGATATCAAAGAAAACCCTGTGATGATATACATGAAAGGGGTGCCAGAACTTCCTCGATG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807751.1
MARSLSNFLYKGIAAFPAASSTASGSFYQGIHRFSTSVPSDPDTHEDFRPTTKVGSSDMSLKDIVEQDIKENPVMIYMKGVPELPRCGFSALAVRVLKEYNVPLSARNILEDLELKNAVKSFSHWPTFPQIFINGEFVGGSDIILNMHQVFVFYFAFLSFLFWINQPILFIVIILFVMQTGELKEKLNVDAEKQQ

XP_057807752.1
MARSLSNFLYKGIAAFPAASSTASGSFYQGIHRFSTSVPSDPDTHEDFRPTTKVGSSDMSLKDIVEQDIKENPVMIYMKGVPELPRCGFSALAVRVLKEYNVPLSARNILEDLELKNAVKSFSHWPTFPQIFINGEFVGGSDIILNMHQTGELKEKLNVDAEKQQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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