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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000470`

染色体: Chr04 坐标: 5020608-5021363 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000470`
名称	SmilChr04G000470
描述	uncharacterized SmilChr04G000470
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5020608 - 5021363 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022350`
GeneID	`131022350`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022350`
原始查询	`LOC131022350`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=48.5; qcov=0.609; evalue=1.24e-24; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=60.4; qcov=1; evalue=3.82e-68; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022350

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807788.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057807788.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807788.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807788.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807788.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5020776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C76
`Chr4:5020786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A10,A25,B110,B119,B121,B128,B131,B136,B15,B22,B26,B27,B29,B4,B40,B42,B43,B52,B57,B60,B62,B66,B72,B81,B99,C19,C30,C42,C50,C57,C60,D7
`Chr4:5020827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B111,C21,C37
`Chr4:5020838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B33
`Chr4:5020853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B72,D10
`Chr4:5020857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:5020888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr4:5020891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B36,B69,C18
`Chr4:5020900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B95
`Chr4:5020900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr4:5020918`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A23,B69,C18
`Chr4:5020918`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A23,B69,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807788.1

169 aa

169

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 83-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807788.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	83	168	3.7e-43	148.3	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951805.1
CCGAGCAAGAAGAAGGAACTGTAACAGAGAACGCGAGATTGGCGAGCAACGTTTGATGAATGACTAATTTGTGGAAAGGCCGACGTATACTCCTCAGATTTTTCGACGTAGATTTCGCATGCAAAAAAATTTGTTTCTTCGTATAGTGGAGGCCATTACTGCCAATGACGAATATTTTCAACAAATACCTGATGCCACAGGTAGACAAGGTCTATCACCGTTGGTGAAATGTACTGGAGCAATACGGGTGTTGGCGTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022350
ATGCAAAAAAATTTGTTTCTTCGTATAGTGGAGGCCATTACTGCCAATGACGAATATTTTCAACAAATACCTGATGCCACAGGTAGACAAGGTCTATCACCGTTGGTGAAATGTACTGGAGCAATACGGGTGTTGGCGTATGGTTCGTCAACTGATGTTGTTGATGAATACTTGCGAATGAGTGAAGCTGCAACAAGGATATTTCTAATAAAATTCGTAGAAGGTATCATTTCCTGCTTCAGTGACGAGTATCTCAGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807788.1
MQKNLFLRIVEAITANDEYFQQIPDATGRQGLSPLVKCTGAIRVLAYGSSTDVVDEYLRMSEAATRIFLIKFVEGIISCFSDEYLRRPTEQDLARLLYIGEERGFPGMIGSIDCMHWEWKNCPTGWAGQYAGRSGKPTIILEVVASYDLWIWHAFFGTPGSCNDINVLH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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