Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000482`

染色体: Chr04 坐标: 5216620-5220529 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000482`
名称	SmilChr04G000482
描述	uncharacterized SmilChr04G000482
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5216620 - 5220529 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022367`
GeneID	`131022367`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022367`
原始查询	`LOC131022367`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FK506-binding-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830278]; symbol=AT5G03990; hit=AT5G03990; species=arabidopsis; confidence=low
产物	FK506-binding-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830278]; symbol=AT5G03990; hit=AT5G03990; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G03990` (AT5G03990) FK506-binding-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830278] identity=44.9; qcov=0.375; evalue=3.14e-27; confidence=low
Rice	`Os01g0801200` - identity=44; qcov=0.275; evalue=4.67e-21; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022367

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807801.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057807801.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057807801.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057807801.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057807801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5218124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B65,B77
`Chr4:5218471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B65,B77
`Chr4:5218524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr4:5218590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:5218762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr4:5218825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,C19,C53,C54
`Chr4:5219060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951819.1
TAAACGTAAGAAAGTAGACGTCACGCAGGAGTTGATTTGGGCATTGGGCAATGGCTGCATCCAAGTCTTGGTGGGAGTAGATGAGTCGCTCCGCATATATATAGCCATACCCATACTACTGATTTTCCATCTTGCTCTTAAAACAATGGGAAATTGGAACCGGAGATATATGCCCAGAAGGAGGAAGCCTAGGCACTACGACTATGACTATGAAGATCCACCTCCATCTCCCCCAACACCCTATTCTTCTGGACTTGCTA...

XM_057951818.1
TAAACGTAAGAAAGTAGACGTCACGCAGGAGTTGATTTGGGCATTGGGCAATGGCTGCATCCAAGTCTTGGTGGGAGTAGATGAGTCGCTCCGCATATATATAGCCATACCCATACTACTGATTTTCCATCTTGCTCTTAAAACAATGGGAAATTGGAACCGGAGATATATGCCCAGAAGGAGGAAGCCTAGGCACTACGACTATGACTATGAAGATCCACCTCCATCTCCCCCAACACCCTATTCTTCTGGACTTGCTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022367
ATGGGAAATTGGAACCGGAGATATATGCCCAGAAGGAGGAAGCCTAGGCACTACGACTATGACTATGAAGATCCACCTCCATCTCCCCCAACACCCTATTCTTCTGGACTTGCTAACAATAGGGTGCCGTCATGGGAAATAGACTATTGCCATTCTTGTAAAGTCCCCTGGAATAAGGTGTTGGCATCCAAAAAGTATATATACAGTTATCCTAGTGTGCTGAATTGGGATGGTTCTGCTGGTAAAGAAGCATTGGAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807801.1
MGNWNRRYMPRRRKPRHYDYDYEDPPPSPPTPYSSGLANNRVPSWEIDYCHSCKVPWNKVLASKKYIYSYPSVLNWDGSAGKEALEKAKQRFWAKINGLLCDDPLPDPDMYIGEIDWNPHIDHELMEDLDLQVFNQDEAEKIEQLGTINEEFDNNQYTSDNPWERDQVLGTGNLKEENGWGRWDDTLQRNDDPWEQSCRKLAGSSKDNAWGSKNEPWDWPKGLDNTRSSSFVDHGCGKSWNCNEKTVAIREDGRGRGWGQ...

XP_057807802.1
MGNWNRRYMPRRRKPRHYDYDYEDPPPSPPTPYSSGLANNRVPSWEIDYCHSCKVPWNKVLASKKYIYSYPSVLNWDGSAGKEALEKAKQRFWAKINGLLCDDPLPDPDMYIGEIDWNPHIDHELMEDLDLQVFNQDEAEKIEQLGTINEEFDNNQYTSDNPWERDQVLGTGNLKEENGWGRWDDTLQRNDDPWEQSCRKLAGSSKDNAWGSKNEPWDWPKGLDNTRSSSFVDHGCGKSWNCNEKTVAIREDGRGRGWGQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器