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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000488`

染色体: Chr04 坐标: 5266728-5270636 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000488`
名称	SmilChr04G000488
描述	protein kinase STUNTED-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5266728 - 5270636 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022369`
GeneID	`131022369`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022369`
原始查询	`LOC131022369`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein kinase STUNTED-like
产物	protein kinase STUNTED-like
Arabidopsis	`AT5G63940` (AT5G63940) kinase with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836515] identity=50.9; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0194900` (OsRLCK315) - identity=48; qcov=0.94; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00582 (Usp); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022369

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057807803.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057807803.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807803.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807803.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807803.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5266932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B13,B140
`Chr4:5266938`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B33
`Chr4:5266938`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B33
`Chr4:5266944`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A1,A4,B117,B121,B123,B129,B131,B14,B31,B37,B40,B51,B54,B76,B81,B82,B84,C14,C38,C52,C64,C84,C86,D9
`Chr4:5266947`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A1,A4,B121,B131,B37,B76,C64,D9
`Chr4:5267055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B41,C83,D2
`Chr4:5267075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr4:5268277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,B98
`Chr4:5268328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:5268373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B134,B65,B77
`Chr4:5268528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:5268893`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B38,B39,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807803.1

698 aa

349

698

Usp

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00582 Usp 34-159 aa PF00069 Pkinase 355-623 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 357-620 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807803.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	34	159	9.6e-10	39.9	Universal stress protein family
`XP_057807803.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	355	623	9.9e-42	143.9	Protein kinase domain
`XP_057807803.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	357	620	2.4e-38	132.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951820.1
GGGAAATGAGAGGTCTAAAGGGATAATAAAACCTCTACTTTTAACAGGGCAGAGAGAGAGTGAGAGGAGAGAGAGAGAGATTCCTGAGTCTCTTTCCTGTTAGCGAGAACAGCCTCATCTCTGGCTTGATCTGCGTTTTGCACGACAATGAGGCTGCCGGCCGAGAGTTCCGGAGTGGTGGAATGCAGTGGCGGCGAGAGTACTGCGGCGGCCGGCGAAGACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCTGTGGTGGTGGTTGGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022369
ATGAGGCTGCCGGCCGAGAGTTCCGGAGTGGTGGAATGCAGTGGCGGCGAGAGTACTGCGGCGGCCGGCGAAGACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCTGTGGTGGTGGTTGGAGTGAAGGTGGACTCTCGGAGTAAAGAGTTGCTGACTTGGGCGCTGGTGAAGGTGGCGCAGAGTGGCGATCGCGTCATTGCTCTTCACGTGCTGGATCCCAACGTCGAGAAATCGGATTTGCTTTCGCTGGTGAAGACTTTTGATTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807803.1
MRLPAESSGVVECSGGESTAAAGEDGGGGGGAVVVVGVKVDSRSKELLTWALVKVAQSGDRVIALHVLDPNVEKSDLLSLVKTFDSMLAAYEGFCNLKQVDLKLKVCKGSPIHKIILREAKSCGATSIILGASGVDHKIRSRTSVAKYCAKNLQKNVSIICVNNGKIVFGRESNASCVSLLGSVDVRRPRSRKRKLSKSPLSLPPQRLLTSSSDETPNVSMALVPIKTREMPESKSGWAVLRKSFFHGLRLPESPSCKKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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