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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000503`

染色体: Chr04 坐标: 5495844-5499449 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000503`
名称	SmilChr04G000503
描述	uncharacterized SmilChr04G000503
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5495844 - 5499449 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022383`
GeneID	`131022383`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022383`
原始查询	`LOC131022383`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome C oxidase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818460]; symbol=AT2G38780; hit=AT2G38780; species=arabidopsis; confidence=high
产物	cytochrome C oxidase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818460]; symbol=AT2G38780; hit=AT2G38780; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G38780` (AT2G38780) cytochrome C oxidase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818460] identity=54.8; qcov=0.794; evalue=1.52e-102; confidence=high
Rice	`Os05g0381500` - identity=54.9; qcov=0.256; evalue=3.38e-34; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022383

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807813.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057807814.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057807813.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057807814.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057807814.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5497127`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C11,C69
`Chr4:5497127`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:5497153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:5497171`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A1,A13,A7,A8,B117,B123,B127,B129,B21,B26,B28,B43,B54,B64,B82,C11,C67,C69,C76,D5
`Chr4:5497172`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A1,A13,A7,A8,B117,B123,B127,B129,B21,B26,B28,B43,B54,B64,B82,C11,C67,C69,C76,D5
`Chr4:5497653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C7,D8
`Chr4:5498015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B6,C49,C63
`Chr4:5498143`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	B13,B18,B28,B4,B42,B43,B47,B5,B73,B87,B95,C35,C50,C67,C75,C85
`Chr4:5498158`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A11,A18,A19,B106,B108,B113,B134,B135,B22,B53,B56,B65,B83,B86,B92,C19,C2,C20,C49,C68,C77,C79,C86
`Chr4:5498776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr4:5498851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951830.1
AGCAATCTGCTTATTTTGACCAGATTTTGTATTCCCATCTTCTGTGGCTCAATTTGGTCCCTTCACATTCCATTAACTTTGAATTCTACCGCTATTATTTTTTTCAAACTCGATTGTTGAAACCAGAAATCATTCATCCAAATTTGTGATTTCAATGGCCTCATTCATCTCCTCCCTCACTCCGATCAATAAAAACAATTTCACACTCTCTCCACAATACAAGAGCTTCCCCACAATCAAAACCTCAAAAATCCAATCCT...

XM_057951831.1
AGCAATCTGCTTATTTTGACCAGATTTTGTATTCCCATCTTCTGTGGCTCAATTTGGTCCCTTCACATTCCATTAACTTTGAATTCTACCGCTATTATTTTTTTCAAACTCGATTGTTGAAACCAGAAATCATTCATCCAAATTTGTGATTTCAATGGCCTCATTCATCTCCTCCCTCACTCCGATCAATAAAAACAATTTCACACTCTCTCCACAATACAAGAGCTTCCCCACAATCAAAACCTCAAAAATCCAATCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022383
ATGGCCTCATTCATCTCCTCCCTCACTCCGATCAATAAAAACAATTTCACACTCTCTCCACAATACAAGAGCTTCCCCACAATCAAAACCTCAAAAATCCAATCCTCAAATTCTCAAGAAACTCCGGCAGAAGACCCTGTTAAGCTTGCATTGGCCAAAGCTAAAGCATACAAAAACTCTGTGAAATCCGGTGTCCCAACTCCGAAGTTCGTCCCTGAAATCAGTGGAAAGAAGGATGATTCCAAGCAAATTAATGAAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807813.1
MASFISSLTPINKNNFTLSPQYKSFPTIKTSKIQSSNSQETPAEDPVKLALAKAKAYKNSVKSGVPTPKFVPEISGKKDDSKQINEIEDDDVEEDVPLAVKIAVEKAKQYKKSKILEDSEGVASNIVGNSDAERGGVDVDGKNDEDEGGGKAIPLSVKLALDKAKEYKKNTGVDNGGVGENQAFVSGLKGGDERSGGDKQSVKSSGKKDELKVSSIDFMGLGFADKKSGRGLPAGLVPLSDPFPGGELPEVEILVGDTSN...

XP_057807814.1
MASFISSLTPINKNNFTLSPQYKSFPTIKTSKIQSSNSQETPAEDPVKLALAKAKAYKNSVKSGVPTPKFVPEISGKKDDSKQINEIEDDDVEEDVPLAVKIAVEKAKQYKKSKILEDSEGVASNIVGNSDAERGGVDVDGKNDEDEGGGKAIPLSVKLALDKAKEYKKNTGVDNGGVGENQAFVSGLKGGDERSGGDKQSVKSSGKKDELKVSSIDFMGLGFADKKSGRGLPAGLVPLSDPFPGGELPEVEILVGDTSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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