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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000506`

染色体: Chr04 坐标: 5516429-5518462 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000506`
名称	SmilChr04G000506
描述	annexin D3
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5516429 - 5518462 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022386`
GeneID	`131022386`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022386`
原始查询	`LOC131022386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	annexin D3
产物	annexin D3
Arabidopsis	`AT2G38760` (ANNAT3) annexin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818458] identity=59.5; qcov=1.01; evalue=3.85e-137; confidence=high
Rice	`Os05g0382900` (OsANN4) - identity=50.2; qcov=1.01; evalue=1.72e-105; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005544 (calcium-dependent phospholipid binding); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00191 (Annexin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022386

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057807818.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057807818.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057807818.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807818.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807818.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5516665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr4:5516732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C13
`Chr4:5516775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr4:5516779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr4:5517177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807818.1

318 aa

159

318

Annexin

PF00191 Annexin 15-79 aa PF00191 Annexin 104-155 aa PF00191 Annexin 174-236 aa PF00191 Annexin 249-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807818.1`	Pfam	`PF00191`	Annexin	Domain	15	79	1.5e-62	208.2	Annexin
`XP_057807818.1`	Pfam	`PF00191`	Annexin	Domain	104	155	1.5e-62	208.2	Annexin
`XP_057807818.1`	Pfam	`PF00191`	Annexin	Domain	174	236	1.5e-62	208.2	Annexin
`XP_057807818.1`	Pfam	`PF00191`	Annexin	Domain	249	313	1.5e-62	208.2	Annexin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951835.1
GGAGGAAGTATAATTAGAAAAATACTCACAAGGAGTTTGGAGAAATAAAATCTGAAGGAGGGGCACAAACGTCTAACGGCCCAAGATAAATTGCAAAAGACATCGCTCATTCCCTCAATTGTAGTCTGTAGAGAAGCGAGGGAAAGAGTGAGAGAAACTGAAACTAAACCCATCGCAAACTCAATAAACAATTCAAATTCAGGAAAGCTAAGAGGAGAAAAATGTCGACGATCAGGATTCCGGAAGTGGTTCCATCTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022386
ATGTCGACGATCAGGATTCCGGAAGTGGTTCCATCTCCAGCTCAAGACTGTGAAACACTCCACAAATCTTGCGAAGGGTGGGGAACGGATGAAGCGGCGTTAATACGGATTCTGGGATGCAGAAATGCAGCGCAGAGAAAACTCATCCGAGACGCATATCAGCAGATTTACTATACTTCCCTCATCGATTGTCTCAGCGAAGAGCTGTCTGGTGATTTCAGGAAAGCAATGATTTTGTGGACATACGATCCCCCGGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807818.1
MSTIRIPEVVPSPAQDCETLHKSCEGWGTDEAALIRILGCRNAAQRKLIRDAYQQIYYTSLIDCLSEELSGDFRKAMILWTYDPPERDARLANEALKSRRKNLTQLQVIVEIACATSPHHLVAVRQAYASLFDTSLEEDIISNVSLPLQKILVSLVRSYRYDKEVVDSSIAKTEAAKLREAVQAKKLDDDELLRILSTRNTFQLRKTFQLYKDNYGTSIDKDVIARGKGIVESVMQVVIWCLDTPEKHFAEVVKASIEGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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