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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001979`

染色体: Chr01 坐标: 35189026-35190877 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001979`
名称	SmilChr01G001979
描述	uncharacterized SmilChr01G001979
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35189026 - 35190877 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022389`
GeneID	`131022389`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022389`
原始查询	`LOC131022389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07468 (Agglutinin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022389

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057807822.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807822.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807822.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807822.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807822.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35189335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C10,C15
`Chr1:35189416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C15
`Chr1:35189572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B27,B66,B93,C12
`Chr1:35189581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B27,B66,B93,C12
`Chr1:35189587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C1
`Chr1:35189956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr1:35189974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C51
`Chr1:35190256`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B103,B71,B77
`Chr1:35190256`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B103,B71,B77
`Chr1:35190278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C4,C47,C51
`Chr1:35190415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:35190498`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807822.1

470 aa

235

470

Agglutinin

PF07468 Agglutinin 5-120 aa PF07468 Agglutinin 165-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807822.1`	Pfam	`PF07468`	Agglutinin	Domain	5	120	4.9e-24	85.9	Agglutinin domain
`XP_057807822.1`	Pfam	`PF07468`	Agglutinin	Domain	165	282	4.9e-24	85.9	Agglutinin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951839.1
AACCGTAACTTTGGTGGCCCTCAATAATTGCATCCGTCGGTCAGAAATTAGGAAAAGCAAAATAGATTTTTTTTTTTTTTTAAATATTTTTGTGTTTGGTTTGTGATGATCTATAAATGAGAGAGCGGAGAAGAAGAGAAGTGTAACAACATCTGCTTAAGAAAAAAAAAGCAGCAGCAATGGCGGCGGAGCTTCCAAATTTCATCGTGCTGAGGGCAACCGTCCAACAGCGGTACGTGTCGCACTTCAAGGAGTCAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022389
ATGGCGGCGGAGCTTCCAAATTTCATCGTGCTGAGGGCAACCGTCCAACAGCGGTACGTGTCGCACTTCAAGGAGTCAGGCCCCCCCGGCTGGAACTTCACAGGCTGGGTCAGCGCCTCCGAACTCAACATTTTCAGCCCACTGGCGCAGATCCAAGTAGAGCAGGCCAAAATCGACGCCCGCTACGTTCACTTCCGCTTCGTCCACACCAACAAGTACTGGGCCAAAGCCAACAACGCCACCCAAATCATCGCAGTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807822.1
MAAELPNFIVLRATVQQRYVSHFKESGPPGWNFTGWVSASELNIFSPLAQIQVEQAKIDARYVHFRFVHTNKYWAKANNATQIIAVADQPVEDLSNPACTLFEPIITPGSTNLALNHVQTDRRIDVVGHGIPPIHFLLQRAPAGTVGTVHFQFIDWDTLITLPRHVAFKGHDGRYVRSLTFQNFPYHQLSADDANATDTGFEVHTMLDGHVRIKSLHFDRFWRRSPNWIWADNNDANSTHADTLFWPVKIDDNTIALRNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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