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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000521`

染色体: Chr04 坐标: 5738820-5745138 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000521`
名称	SmilChr04G000521
描述	uncharacterized SmilChr04G000521
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5738820 - 5745138 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022401`
GeneID	`131022401`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022401`
原始查询	`LOC131022401`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NagB/RpiA/CoA transferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819918]; symbol=AT3G07300; hit=AT3G07300; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NagB/RpiA/CoA transferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819918]; symbol=AT3G07300; hit=AT3G07300; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G07300` (AT3G07300) NagB/RpiA/CoA transferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819918] identity=79.3; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0392700` - identity=73.5; qcov=0.636; evalue=1.2e-133; confidence=high
GO	GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity); GO:0005851 (eukaryotic translation initiation factor 2B complex); GO:0006413 (translational initiation)
KEGG	-
Pfam	PF01008 (IF-2B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022401

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807839.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057807839.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807839.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807839.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807839.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5739900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B98
`Chr4:5740746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:5740953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:5744867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807839.1

415 aa

208

415

IF-2B

PF01008 IF-2B 19-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807839.1`	Pfam	`PF01008`	IF-2B	Family	19	391	2.7e-68	230.9	Initiation factor 2 subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951856.1
GAAATGGATGCTTTCGGGTTCCAAACTGGGCAAGGTGTACCCGACCCGACCCGACCGGTAAACCCTTTGAAAGTGAAACCTCATACATTGACAGCACCACCTTCTTCTTCAACACTCCCCCGCGGAGCTGAGCCCTCATATCCGTACGTAAAATCGACGCAAGTCTTTGATTCAATTCCTTAAACCCCAATTATCCCCTAATTCACAAACTACATCAATTTTTTTCTTTTATCTTACCCGATAGAATCATGCCGGACGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022401
ATGCCGGACGTGCATTCCTTCGTGAATGAGTTCGTAATCAAGCTCAACAAACGCCAAATCGAGGGGTCGAAGACGACGGCGAAGCTGACGGCGGAATTGCTCCGTTCCTTCATATCTCAACAGAGGCTGCCGCACAGTAACCAAGCTGGGGCTCTCATTGACGCCGTCAAGGTGGTCGGGGAGAAACTCATTGCTGCTAAACCTGTTGAGTTGGCTGTTGGGAATGTTGTCCGCCGTGTTCTACATATCATACGCGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807839.1
MPDVHSFVNEFVIKLNKRQIEGSKTTAKLTAELLRSFISQQRLPHSNQAGALIDAVKVVGEKLIAAKPVELAVGNVVRRVLHIIREEDLSLTNAAVGGLSLASESDDEDGNEEYDHPVLSATAVAAAARNALRPPSLQTLLEDIPHSAAVPHTSSSGGDSEGKSKSADKNSMTRKLKHNVIEAVNELIQEISTCHEQIAEQAVEHIHHNEVILTLGSSQTVKEFLLAAKEKKRSFRVFVAEGAPRYQGHAFAKELAARGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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