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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000527`

染色体: Chr04 坐标: 5787434-5789087 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000527`
名称	SmilChr04G000527
描述	uncharacterized protein At5g39865-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5787434 - 5789087 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022409`
GeneID	`131022409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022409`
原始查询	`LOC131022409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831226]; symbol=AT5G13810; hit=AT5G13810; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831226]; symbol=AT5G13810; hit=AT5G13810; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G13810` (AT5G13810) Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831226] identity=52.8; qcov=0.947; evalue=7.03e-88; confidence=high
Rice	`Os07g0659900` (OsGRL16) - identity=53.4; qcov=0.525; evalue=2.06e-51; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00462 (Glutaredoxin); PF23733 (GRXCR1-2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807858.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807858.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057807858.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807858.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5788268`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A16,B103,B107,B111,B120,B122,B130,B134,B138,B20,B35,B55,B57,B64,B67,B73,B90,C11,C12,C17,C18,C20,C21,C30,C31,C46,C48,C54,C56,C65,C67,C74,C78,C79,C87,D2
`Chr4:5788303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C21,C31,C46,D2
`Chr4:5788306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C21,C31,C46,D2
`Chr4:5788310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C21,C31,C46
`Chr4:5788386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B31,C58
`Chr4:5788424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B40,C30,C48,C75
`Chr4:5788510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr4:5788513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr4:5788555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807858.1

282 aa

141

282

Glutaredoxin

GRXCR1-2_C

PF00462 Glutaredoxin 138-205 aa PF23733 GRXCR1-2_C 235-281 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807858.1`	Pfam	`PF00462`	Glutaredoxin	Domain	138	205	2.9e-11	44.1	Glutaredoxin
`XP_057807858.1`	Pfam	`PF23733`	GRXCR1-2_C	Domain	235	281	4.9e-19	68.7	GRXCR1/2, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951875.1
AATAATTGTCACATTATTCGTTAGCTCAACTGTTGAGGAAGTCCAACTGTTTATCATACAATTTTGATAATTGCAACATCACACAATTTTGTTAGTTTTTAATGTTATTATTACAAACCCAAAATGTATTTAATAAAAAAGGGAAAAAGAAAGCATAACCGAAAAACCATAAAACACAGTCCTTGATAACTCCATATCTCGAAAGCATATACCGCGTTGTCTCTCTCTCTCTCTGCGTCTGCGTGTTATGCAATAATCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022409
ATGTCCGATTGGAAGAATCAGGAAATGGAATCGCCCGATATAAGCCAGAAACCCGGTTTTTCGTCCTACTTCAATCGGTCGCTGACGTTCAATTCCCCTTCTTCGGCGGCGGAGGACGAAGTCACCACTAAGCCCCTCTACAACCTCTACGCCACCCCCGCGCTGCAGCGGGGCGGCTCGATCAAGAGCCTCTACAGCTCCCCGTTTGGTTCGATGGTCTCCGCCGGGAACTCACTCAAGGGCAAAGTCAGGAAGTTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807858.1
MSDWKNQEMESPDISQKPGFSSYFNRSLTFNSPSSAAEDEVTTKPLYNLYATPALQRGGSIKSLYSSPFGSMVSAGNSLKGKVRKLCSIFESPKQPPLPSKPSKLLLAAPDSSNFVPKSIPSPVADGPFRLPGTEDRVVIYHTSLRGIRKTFQDCHSIRMIFRGLRVNIDERDISMDVAYRKELQRVLGENHISLPQVFIKGKYIGGADVIRQLLEAGELLRLIKGLPLRPAKPCEACDDMRFAPCGNCSGSRKVFDEDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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