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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000529`

染色体: Chr04 坐标: 5823880-5824994 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000529`
名称	SmilChr04G000529
描述	two-component response regulator ARR9-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5823880 - 5824994 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022413`
GeneID	`131022413`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022413`
原始查询	`LOC131022413`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator ARR9-like
产物	two-component response regulator ARR9-like
Arabidopsis	`AT3G57040` (ARR9) response regulator 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824871] identity=67.8; qcov=0.864; evalue=2.05e-69; confidence=high
Rice	`Os11g0143300` (OSRR9) - identity=69.9; qcov=0.83; evalue=1.38e-68; confidence=high
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00072 (Response_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022413

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807864.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057807864.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807864.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807864.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5824070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:5824149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:5824243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr4:5824398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C37
`Chr4:5824496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B78,B87,C48
`Chr4:5824537`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr4:5824537`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807864.1

176 aa

176

Response_reg

PF00072 Response_reg 12-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807864.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	12	137	1.1e-18	68.1	Response regulator receiver domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951881.1
CAAATCGAGGGCGAGGAATACTAAAACAAACTTCATTGCTTCTTCTCCAATTCAAAAATCAACTTACAAAAATCATCAAGATTCTGAATCATATCCCCATCTCTCCATATCTTATAGTATCTCTCTCTCTCTCTCTTCAAACCTCTCCTCATATATATTCCACATTTCATTCCTCTCCACATCACCATTTCTCCCTCCTTCAATTCTTCTTCAACTCTCAAATTTAATCCCACAAATATAAATATATAAGCATGAACGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022413
ATGAACGGATTAGCAGCAGAAACGCAGTTCCATGTGCTAGCAGTTGATGATAGCATCATTGATAGAAAATTGATTGAGAGGCTGCTTAAAACTTCTTCTTATCAAGTTACCGTTGTGGAATCCGGAGTTAAGGCTCTTGAATTCTTGGGATTGGTTGACGATGAAGAAGATGATGAAATTTCAAATTCAAATTCAAATTTCCAAAGAGTTGAAGTCAATCTGATCATCACAGATTACAGCATGCCAGCAATCACCGGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807864.1
MNGLAAETQFHVLAVDDSIIDRKLIERLLKTSSYQVTVVESGVKALEFLGLVDDEEDDEISNSNSNFQRVEVNLIITDYSMPAITGYDLLRKIKKSSWLKDIPVVIMSSENVPSRINSCLENGAEEFFLKPVRQSDVNKLRPHLMRGKNTNINKRKPAQECLSPDRTRTRFNHDLE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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