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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000536`

染色体: Chr04 坐标: 5958838-5964118 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000536`
名称	SmilChr04G000536
描述	uncharacterized SmilChr04G000536
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5958838 - 5964118 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022418`
GeneID	`131022418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022418`
原始查询	`LOC131022418`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0272800; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0272800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0272800` - identity=54.5; qcov=0.746; evalue=1.88e-70; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13369 (Transglut_core2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807871.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807872.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057807872.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057807871.1`
5	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057807872.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5960956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:5961305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:5961498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B60
`Chr4:5962838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B1
`Chr4:5962838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:5962839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:5962873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B23
`Chr4:5963555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B122
`Chr4:5963784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C67
`Chr4:5963824`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B132,B5
`Chr4:5963824`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B132,B5
`Chr4:5963829`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B132,B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807871.1

416 aa

208

416

Transglut_core2

PF13369 Transglut_core2 129-209 aa

XP_057807872.1

280 aa

140

280

Transglut_core2

PF13369 Transglut_core2 13-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807871.1`	Pfam	`PF13369`	Transglut_core2	Family	129	209	6.3e-07	29.7	Transglutaminase-like superfamily
`XP_057807872.1`	Pfam	`PF13369`	Transglut_core2	Family	13	73	1.6e-06	28.4	Transglutaminase-like superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951888.1
GTTATTCGTTACCAAATTTTCACGTTTTTTCTACTTTATACTGTAGAATTTGAACTTAAAAACATTATAATAATGGCTAAAATACAAACTAAAATACTCCGCAACTCTGATTTGGCCGTCGATCATTCTCTCTCCAGATATTTCAGAAAAAGACAATATAGATATTTAATTATCCTGATTAAACTTATTTCACAAAATTACTAATTCATATGTTGAATTTGTAGTAGCTCAATAATCCCGGGAAATAATTAGTTGTCGAT...

XM_057951889.1
ATTCCATCCTTCCACACGGAGCGTGAATTGCCGCTGTAAATGTGGATTATCCGCTGAAGATGATTTGAAATTTGTGCTTCATGATGCGCTTGATTTTTCCGGCATCGACACGTCCCACGCGAGGTTTGTGAAGTCAGCTATTCGATCAATTCTGTTGCGAAATTAGCCATTCTGGAAGGATAATTCTAAGCTGCAAGGGTAGGTTTTTGCGCGCAGATAAAAAATTTCTCTGACCTTGAGAGAGGAACAAGTATCACTAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022418
ATGGCGTTTCCATGGATTTTATCGAACAGCTTAGCATTATCTTCCTCATCAACTTGCAATTTTCTTCCATGGACTCTGCCCAAATTCCAATTCCATCCTTCCACACGGAGCGTGAATTGCCGCTGTAAATGTGGATTATCCGCTGAAGATGATTTGAAATTTGTGCTTCATGATGCGCTTGATTTTTCCGGCATCGACACGTCCCACGCGAGGGCTGCAAGGGTAGGTTTTTGCGCGCAGATAAAAAATTTCTCTGACCT...

LOC131022418
ATGGGCTATTGCTCTCAATACAGCTCCTCATTTAGATCCTCACCGGAGAATTTTCTTGACTGTTTAGAAAGATACCTCTACCTCAACAAAGGTTTTCGAAGAACAAGTACAAGAAACCATGTTGAGCACCGCGCCCTATATCTCAATTCAGTCTTAACACATCGTTCTGGCTCTGTTACCATGCTCTCCCTTATATACTCAGAGATCCTAAAGATGCTTCGCATGTGGGGAGTCCTGAATTTTGATGTGGAAATCTTCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807871.1
MAFPWILSNSLALSSSSTCNFLPWTLPKFQFHPSTRSVNCRCKCGLSAEDDLKFVLHDALDFSGIDTSHARAARVGFCAQIKNFSDLERGTSITINRGVDLARAALQIAAEDDSLISHSSVPLPVDDFIERLDTLSMGYCSQYSSSFRSSPENFLDCLERYLYLNKGFRRTSTRNHVEHRALYLNSVLTHRSGSVTMLSLIYSEILKMLRMWGVLNFDVEIFFPHDSHSSPRGYLKQKSKESDQSHIMTSQSLLVEILKD...

XP_057807872.1
MGYCSQYSSSFRSSPENFLDCLERYLYLNKGFRRTSTRNHVEHRALYLNSVLTHRSGSVTMLSLIYSEILKMLRMWGVLNFDVEIFFPHDSHSSPRGYLKQKSKESDQSHIMTSQSLLVEILKDLKNAFWPFQLDHARSPFIRAAEAAHCVTGANNANESASQLASAKAGRHRLQRGVWTSVHFGDMRRALSACERLILLKHDPKELRDYGVLLYHCGYYEEALQFLKHYRDTEQSGLIDNVEEDAVEKLVVRLNLILME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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