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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000557`

染色体: Chr04 坐标: 6225676-6228510 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000557`
名称	SmilChr04G000557
描述	uncharacterized SmilChr04G000557
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6225676 - 6228510 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022439`
GeneID	`131022439`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022439`
原始查询	`LOC131022439`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aminotransferase-like, mobile domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841497]; symbol=AT1G50750; hit=AT1G50750; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aminotransferase-like, mobile domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841497]; symbol=AT1G50750; hit=AT1G50750; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G50750` (AT1G50750) aminotransferase-like, mobile domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841497] identity=32; qcov=0.164; evalue=8.18e-07; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10536 (PMD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022439

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807908.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057807908.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057807908.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807908.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807908.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6227088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B65
`Chr4:6227097`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	55	A1,A15,A18,A19,A21,A9,B1,B104,B105,B110,B113,B12,B120,B122,B13,B130,B133,B137,B16,B24,B25,B26,B32,B44,B50,B51,B53,B62,B66,B74,B8,B82,B84,B86,B98,C11,C14,C16,C2,C23,C25,C26,C3,C34,C48,C63,C7,C73,C74,C8,C82,C85,D11,D2,D7
`Chr4:6227221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B119,B45
`Chr4:6227224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B84,C14
`Chr4:6227231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:6227236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B119,B45
`Chr4:6227239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B119,B45
`Chr4:6227275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:6227327`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	A14,A18,A22,A6,A7,A8,B100,B105,B119,B12,B125,B133,B19,B21,B22,B24,B29,B34,B37,B45,B51,B65,B69,B73,B79,C15,C24,C29,C42,C47,C5,C51,C75
`Chr4:6227445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr4:6227524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C71,D9
`Chr4:6227526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807908.1

476 aa

238

476

PMD

PF10536 PMD 307-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807908.1`	Pfam	`PF10536`	PMD	Domain	307	397	8.2e-20	72.0	Plant mobile domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951925.1
ATGGTGGTCTTCAAAGATATTGTGGTCAAGGGTCAAGACTATTTGCTGATTTTGAGTGATGATGAGCAAGAGACGGAAATGGGCATGCATCTAAGAGTATTTCCGGCATTGATAGGCCACTATGTGAAACCTTGGCCCAAACTTTTGAATTCTCTATATCAGTCGGAATGGACCAGCGAGATCAGTTTGAACAAAGCGTCGAAGGCTCATACATTGCATCCGGCCCGTCCTTGGCAAAGCAAGGAATCCAATTTTCTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022439
ATGGTGGTCTTCAAAGATATTGTGGTCAAGGGTCAAGACTATTTGCTGATTTTGAGTGATGATGAGCAAGAGACGGAAATGGGCATGCATCTAAGAGTATTTCCGGCATTGATAGGCCACTATGTGAAACCTTGGCCCAAACTTTTGAATTCTCTATATCAGTCGGAATGGACCAGCGAGATCAGTTTGAACAAAGCGTCGAAGGCTCATACATTGCATCCGGCCCGTCCTTGGCAAAGCAAGGAATCCAATTTTCTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807908.1
MVVFKDIVVKGQDYLLILSDDEQETEMGMHLRVFPALIGHYVKPWPKLLNSLYQSEWTSEISLNKASKAHTLHPARPWQSKESNFLLTLRRRIIDKDAKWGRVTSFRGEFHFFEGYWEWTEDILSRCGNELRVVGIYDAVYASLFTYDCQPEMVKAFCEAWCPATNTILTSSGEMSISLWDLQYLSGLPCTGTLYDEVVPCAKEILGKDQFGNPFIPLSCRYLLSAYYSLKYRDGKDPKSSVSIDEWIKFWSKKASKYSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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