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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000564`

染色体: Chr04 坐标: 6287465-6291820 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000564`
名称	SmilChr04G000564
描述	CO(2)-response secreted protease-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6287465 - 6291820 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022447`
GeneID	`131022447`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022447`
原始查询	`LOC131022447`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CO(2)-response secreted protease-like
产物	CO(2)-response secreted protease-like
Arabidopsis	`AT1G20160` (ATSBT5.2) Subtilisin-like serine endopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838606] identity=43.8; qcov=1; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os01g0278950` (OsSub1) - identity=55.6; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022447

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057807916.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057807916.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057807916.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807916.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807916.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6288189`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A4,B115,B138,B23,B44,B83,B84,B87,C11,C48,C59,C69,D11,D9
`Chr4:6288192`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A4,B115,B138,B23,B44,B83,B84,B87,C11,C48,C59,C69,D11,D9
`Chr4:6289543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,A3,B114
`Chr4:6289588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B42,B43
`Chr4:6289654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B84,C48,D11
`Chr4:6290202`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B3,B52,B91
`Chr4:6290202`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B3,B52,B91
`Chr4:6290231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B31,B41,B66,C79
`Chr4:6290481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B122,B42,B43
`Chr4:6290486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B140,B70,C13
`Chr4:6290804`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C35
`Chr4:6290804`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807916.1

759 aa

380

759

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 29-108 aa PF00082 Peptidase_S8 135-586 aa PF17766 fn3_6 660-756 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807916.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	29	108	3.3e-15	57.3	Peptidase inhibitor I9
`XP_057807916.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	135	586	6.9e-44	151.0	Subtilase family
`XP_057807916.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	660	756	1.2e-21	77.5	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951933.1
ATCAACACTTATAATGCATGGATTAATTATATATAAATTTTCATTTTCATTTTCTTTATTTAATCAACCTTGTGCCATTTTGGTGCTTAATTATCTGTATAGATGTTAAGTAATCATTAAATTAATTCACACACTGAAGAAAATCTTGTCATGAAAGCAAGGAATTTCAGATAGTGTCAAGTTTTTCTTTGCTTATTTGCATGGAACATGTTTCTTTTAACAGATGTCTTGTTTTAGACAAAAGACACAAACACTATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022447
ATGGCTTCTGTGCTGCAGCTCTTCTACATTCAATTCTCCTTCATCATTATCTGCTGTATGGCATCAAAACCAAGCATTCAGCCTTACATTGTTTATATGGGGAGTTCTTCGAGTTTAAGTGCAGGCGATGATGACTCGTCCCATCTGCAGCTGCTATCATCCTTGATCCCAAGTGAAGAAGAGAGTGAGAGAAGATTCTTGTTGACATCCTACAATCATGCTTTGAAGGGATTCTCTGCTATGCTTACAGAGACTGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807916.1
MASVLQLFYIQFSFIIICCMASKPSIQPYIVYMGSSSSLSAGDDDSSHLQLLSSLIPSEEESERRFLLTSYNHALKGFSAMLTETEASVLSGHDEVVSIFPDPVLKLHTTRSWDFLEAADSGFRSRYPYEQKSVDVIIGIIDTGIWPESPSFSDHQIGKIPSKWKGVCMEGSDFNKSNCNRKLIGARFYSNEASPGSPRDFLGHGTHTASTAGGAPVANANFYGLARGTARGGFPSARIATYKACSEEGCPGSIILKAID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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