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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000568`

染色体: Chr04 坐标: 6332943-6351259 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000568`
名称	SmilChr04G000568
描述	protein unc-13 homolog
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6332943 - 6351259 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022451`
GeneID	`131022451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022451`
原始查询	`LOC131022451`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein unc-13 homolog
产物	protein unc-13 homolog
Arabidopsis	`AT5G06970` (AT5G06970) plant/protein (DUF810) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830588] identity=66.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0346700` (P0512H04.9-1) - identity=31.3; qcov=0.894; evalue=2.79e-143; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25761 (TPR_PATROL1); PF27629 (UNC13_3rd); PF27630 (UNC13_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807918.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057807918.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057807918.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057807918.1`
5	Phragmoplast	Phragmoplast	0.20000	`XP_057807918.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6333641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B24,B75
`Chr4:6333695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B54,B76,C32,C68
`Chr4:6334383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr4:6334390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B7,B96
`Chr4:6335305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B60
`Chr4:6335311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B140,B70,C13
`Chr4:6335339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr4:6335349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B76,D11
`Chr4:6340230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:6340370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B68,B96
`Chr4:6341458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B120,B62
`Chr4:6342420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807918.1

1107 aa

554

1107

UNC13_N

UNC13_3rd

TPR_PATROL1

PF27630 UNC13_N 9-76 aa PF27629 UNC13_3rd 453-569 aa PF25761 TPR_PATROL1 717-1105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807918.1`	Pfam	`PF27630`	UNC13_N	Domain	9	76	1.4e-31	108.7	UNC13 N-terminal domain
`XP_057807918.1`	Pfam	`PF27629`	UNC13_3rd	Domain	453	569	7.8e-48	162.4	UNC13 third domain
`XP_057807918.1`	Pfam	`PF25761`	TPR_PATROL1	Repeat	717	1105	4.8e-129	431.5	PATROL1-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951935.1
AATTTTAATTTGGGTAATCACAAGGAGTAGTAATTTATACGCTGCTTTTTTCCGTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACAGTTCAAACCTCTCTCTCTGCATGCGTGACCAGATAAGTCTGCAGTTCACATCTGAAGTTCCATTCAATACAGATACATTCCCATTCTCTGCAAAGATCAGTCTTACACCACTCCATTTCAAGATTTTGTATCTATACTTGATTGGACTCTTCGGTTCCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022451
ATGGATGAGGAGAACGAGGTCGAACTTTTGCAGAGATATCGACGGGACAGACGGGTACTCTTAGATTTCATACTCTCTGGTAGCTTGATAAAGAAGGTAGTAATGCCGCCAGGAGCAGTGTCGTTAGATGATGTGGATCTGGATCAAGTCAGCGTCGATTTTGTCCTGAATTGTGCTAAGAAAGGTAGTATGCTTGAACTCTCAGAGGCCATTCGAGATTACTATGATGGCACTCTATTCCCTAGCATGAATAATGCAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807918.1
MDEENEVELLQRYRRDRRVLLDFILSGSLIKKVVMPPGAVSLDDVDLDQVSVDFVLNCAKKGSMLELSEAIRDYYDGTLFPSMNNAGSSDEFFLVTSAESSGSPPRRPPPLVPDVVATSILSNLSISEPIESELIEESQSLSKSQSLNSSQPKELTVDDIDDFDDDIMEEMESRRYSRRVLNDASDVVLRLPSFSTGISDEDLRDTAYEILLSAAGASGGLIVPSKEKKKDTKSRLMKKLGRSKSEQAGTQSHNAHGLVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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