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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000580`

染色体: Chr04 坐标: 6451186-6462318 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000580`
名称	SmilChr04G000580
描述	branched-chain-amino-acid aminotransferase-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6451186 - 6462318 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022461`
GeneID	`131022461`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022461`
原始查询	`LOC131022461`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	branched-chain-amino-acid aminotransferase-like protein 1
产物	branched-chain-amino-acid aminotransferase-like protein 1
Arabidopsis	`AT5G27410` (AT5G27410) D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832800] identity=71.2; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0359100` - identity=75.3; qcov=0.168; evalue=1.59e-44; confidence=weak
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0019752 (carboxylic acid metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01063 (Aminotran_4); PF19798 (Sulfotransfer_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022461

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807930.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057807930.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807930.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807930.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807930.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6452494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B27,B90,C43,C87
`Chr4:6456826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B56,B7,B96
`Chr4:6457303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:6460188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C41
`Chr4:6461478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,C32,C68
`Chr4:6461946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807930.1

554 aa

277

554

Sulfotransfer_5

Aminotran_4

PF19798 Sulfotransfer_5 12-239 aa PF01063 Aminotran_4 289-516 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807930.1`	Pfam	`PF19798`	Sulfotransfer_5	Domain	12	239	3.3e-44	151.7	Sulfotransferase domain
`XP_057807930.1`	Pfam	`PF01063`	Aminotran_4	Domain	289	516	3.2e-50	171.8	Amino-transferase class IV

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951947.1
TATCGTTAGCGTGAGACATTTTTTAGAATTCGCGTGGCCTTTACCTATTTTCAATTATAATGACCAAGTTTACCGCATGATCATCACTCTTAAAAATGGAGCAAAACGGATTCTACATTTCTATCTGGAGCTCCATTGAAGGAATTTGCGGCAACGAATTTGTTGGCGCACACTAGGAAGAGGGAGCTTTAGATTTGCTCATTGCCGTTGATTGTCTCGATAGTGTTCAATTATTACTGCCAGCGGTTTATTCGTTCGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022461
ATGGTGAGGAACACAGGTGAAGTAGAGGTGATACACTTGTGGTCCTCGCCGCGGTCCGTCAGCACAAGCCTTATGTATTCTTTTGCTCAGAGAGATGACACAGAAGTTCTTGACGAACCCCTATATGCGAACTATTTGCGAGTAACAGGAGATCAAAGGCCTTATAGAGAAGAATTCCTGTCAAAATCGGAATCAGATGGAAATAAGGTTATACGGGAAATCATTTTTGCTCCTGGAGAGAAGACATATAGGTTCTGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807930.1
MVRNTGEVEVIHLWSSPRSVSTSLMYSFAQRDDTEVLDEPLYANYLRVTGDQRPYREEFLSKSESDGNKVIREIIFAPGEKTYRFCKHIAGQFLPGLTSDLMKRGKHCILIRNPLDVLTSYSKVSPPSFAVLGYDSLVSIYNELHDQGKLPPVIDSDLLREDPEATLRHLCGDLGIPFQTSMLKWEPGPKPFDGMWAPYWYKNTHKSTGFERPKKYPSPFPSSSYNLLEQTLPFYNLLRGYVRGSSNCAQPALPVSTNEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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