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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000599`

染色体: Chr04 坐标: 6768654-6771590 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000599`
名称	SmilChr04G000599
描述	uncharacterized SmilChr04G000599
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6768654 - 6771590 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022501`
GeneID	`131022501`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022501`
原始查询	`LOC131022501`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleolar essential protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824867]; symbol=AT3G57000; hit=AT3G57000; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nucleolar essential protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824867]; symbol=AT3G57000; hit=AT3G57000; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G57000` (AT3G57000) nucleolar essential protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824867] identity=54; qcov=1.06; evalue=1.23e-106; confidence=high
Rice	`Os02g0290400` - identity=50.7; qcov=1.01; evalue=6.16e-93; confidence=high
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0070037 (rRNA (pseudouridine) methyltransferase activity); GO:0070475 (rRNA base methylation)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03587 (EMG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022501

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807998.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057807998.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.60000	`XP_057807998.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057807998.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057807998.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6769903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B140,C13
`Chr4:6770830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr4:6770883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr4:6771021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807998.1

281 aa

140

281

EMG1

PF03587 EMG1 78-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807998.1`	Pfam	`PF03587`	EMG1	Family	78	275	2.2e-61	207.5	EMG1/NEP1 methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952015.1
TGAAAACCCTAGATCATTCCGCTAAAAAAAATAATAATAATAAAAAAAACATTCTGCCGTCCATCCCCTGCCGTAATTTTCTCACTCTGACCTCTCTCCCTTTGCGGCGGCACCCCCCAGCGGCCCAGCCCTTCCTCCTCCGCCTCCGGCGCCAGCAGCAGCCCACCTGCCATCCGTGCGCATCCCTGCTCCTCCACAGCGGCACAGCCCGCTGTCGACCGTCGCCGGCGTCCAGCAAAGCAGTAGCGTTCAAGCTGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022501
ATGGGGCGGGCATACAAAATGAAAGGGCAGAAAAGGAAGAACAAAGAGGAGAAATACGACAGAGAGGAAGAACCGGAGCAATTAGTTGAAAATTTCACGCCGCAGCCGTCGAAGAAAGTGAAGACGGACTGTTCGGGGTTGGAAAATGAGGAAAAATTGGAGAATGTGGTTGATGATATGCCCGGAATTCCGATTGCTGTGGACACGGGCAATAACAAGCAGCGCGTCATCTTTGTTCTTGAAAAGGCCTCGCTGGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807998.1
MGRAYKMKGQKRKNKEEKYDREEEPEQLVENFTPQPSKKVKTDCSGLENEEKLENVVDDMPGIPIAVDTGNNKQRVIFVLEKASLEIAKVGKTYQLLSSDEHANFLVKNKRNPADYRPDIAFQAIQTILDSRVNKSGRLKALYVRTQQGLLMEIKPHARMPRTYKRFSGLMVQLLQKLHITATGNGEKLLRLVKNPVTQYLPTNSRKIGFSHSSEKLIDMYNYVGNINEELDLVFVLGAMAHGKIDEDYVEDYISISEYP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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