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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000657`

染色体: Chr04 坐标: 7436132-7437297 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000657`
名称	SmilChr04G000657
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7436132 - 7437297 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022529`
GeneID	`131022529`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022529`
原始查询	`LOC131022529`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
产物	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
Arabidopsis	`AT2G37820` (AT2G37820) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818359] identity=43.2; qcov=0.949; evalue=1.28e-68; confidence=medium
Rice	`Os07g0611200` - identity=35.9; qcov=0.535; evalue=1.71e-23; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022529

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808024.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057808024.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057808024.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808024.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808024.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7436164`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A18,A20,B112,B122,B139,B18,B22,B41,B48,B60,B98,B99,C16,C18,C21,C22,C39,C44,C50,C58,C61,C62,C78,D3,D4
`Chr4:7436187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,D7
`Chr4:7436240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,D7
`Chr4:7436329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:7436349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:7436471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:7436480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B44,C20
`Chr4:7436614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:7436619`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A1
`Chr4:7436619`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A1
`Chr4:7436628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B41
`Chr4:7436670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808024.1

312 aa

156

312

C1_2

PF03107 C1_2 36-78 aa PF03107 C1_2 89-139 aa PF03107 C1_2 150-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808024.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	36	78	6.3e-27	94.4	C1 domain
`XP_057808024.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	89	139	6.3e-27	94.4	C1 domain
`XP_057808024.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	150	193	6.3e-27	94.4	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952041.1
AAAATCAATGCAGGCCTGCAAAGAAAAAGCCTTGTTTTTATCCTTGATTGATTCACATTCTCAACAAGGCTTCAATTCCATGGCTCCTCTACCAAAAAACTCCATAGACCACTTCACTCACGCCCACCCTCTCGCAGCCGCAGACGACGATCAAGAATTCTCCTGCGACGGCTGCAAGACTATCGGAATCGGGAAGCGATTCCGATGCAAAGCCTGCGATTTCGACCTCCACGACTACTGCGGCACGTGCCCCCGTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022529
ATGCAGGCCTGCAAAGAAAAAGCCTTGTTTTTATCCTTGATTGATTCACATTCTCAACAAGGCTTCAATTCCATGGCTCCTCTACCAAAAAACTCCATAGACCACTTCACTCACGCCCACCCTCTCGCAGCCGCAGACGACGATCAAGAATTCTCCTGCGACGGCTGCAAGACTATCGGAATCGGGAAGCGATTCCGATGCAAAGCCTGCGATTTCGACCTCCACGACTACTGCGGCACGTGCCCCCGTTCCCTCCCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808024.1
MQACKEKALFLSLIDSHSQQGFNSMAPLPKNSIDHFTHAHPLAAADDDQEFSCDGCKTIGIGKRFRCKACDFDLHDYCGTCPRSLPSFMHHHALTLVLRKPAKPGAARAVNRVCDVCRESVDGLFYRCKECEFDVHPLCTQLPEKLKHALHKVHPLILRSPPAAGACAVCRRPCSGWRYGCGACRVDIHLECVLEPVVGFQQHDFNTGQRGIPTFDHNTGIPFQAPPHFPPFYGYPYGPGYPSYGPGFNMYYGGGPNMYP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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