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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000672`

染色体: Chr04 坐标: 7621166-7626114 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000672`
名称	SmilChr04G000672
描述	glycerol-3-phosphate acyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7621166 - 7626114 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022544`
GeneID	`131022544`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022544`
原始查询	`LOC131022544`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycerol-3-phosphate acyltransferase 1-like
产物	glycerol-3-phosphate acyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT1G06520` (GPAT1) glycerol-3-phosphate acyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837163] identity=56; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0735900` (GPAT) - identity=51.3; qcov=0.871; evalue=5.86e-144; confidence=high
GO	GO:0010143 (cutin biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016791 (phosphatase activity); GO:0090447 (glycerol-3-phosphate 2-O-acyltransferase activity)
KEGG	smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01553 (Acyltransferase); PF12710 (HAD); PF23270 (HAD_RAM2_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022544

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057808034.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057808034.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808034.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808034.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808034.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7621288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr4:7621309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:7621319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:7621344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr4:7621379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B67,D11
`Chr4:7621434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:7621474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B75
`Chr4:7621532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:7621542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr4:7621555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C57,C64,C66
`Chr4:7621645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A3,B69,C41,C84
`Chr4:7621688`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808034.1

502 aa

251

502

HAD_RAM2_N

HAD

Acyltransferase

PF23270 HAD_RAM2_N 32-213 aa PF12710 HAD 34-188 aa PF01553 Acyltransferase 303-403 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808034.1`	Pfam	`PF23270`	HAD_RAM2_N	Domain	32	213	7.2e-66	222.2	Glycerol-3-phosphate acyltransferase RAM2-like, HAD-like domain
`XP_057808034.1`	Pfam	`PF12710`	HAD	Family	34	188	6e-10	40.5	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057808034.1`	Pfam	`PF01553`	Acyltransferase	Family	303	403	8.3e-08	32.8	Acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952051.1
CCTTCGTTTAAGACAATGCTTTTCATTCCCATGCTTTGGACTAAGGTATTCTTGGGAAACAAAGATTAATAAGTAAAGTAGTAATTGCTCATTCTACAGAATCGATATTGCATACAGTCTGTGGCGGAGAATTCTTGAGCCACCCCAATTCCCAAAACCTAACCCAATTCATAATTATCTCCCTCTCATGCGCGCCTCTAATCGCCCCCAACCCAATTCCAGACCAGGGAGACGCCTCACACAGCCACCTGTACACACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022544
ATGCTACAAAGCCACTATGAAGCTCAAGAAATCCGCCCCCCTCCGCCGCCGCACCCCAGCCTCTCCAAATTCAGCCCCCGCGGGGGCCGGGTGTCGCTCGTCTGCGACATCCACCGCTGCCTCCTGCGATCGCCCTCCTTCTTCCCCTACTTCATGCTCGTCGCCTTCGAGGGCGGCGGCCCCCTCCGCGCCCTCCTCCTCCTCCTCTCGTGCCCGCTCCTCCTCCTCCTCGACTACGAGACCAAGATGCGCGCCATGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808034.1
MLQSHYEAQEIRPPPPPHPSLSKFSPRGGRVSLVCDIHRCLLRSPSFFPYFMLVAFEGGGPLRALLLLLSCPLLLLLDYETKMRAMIFITFCGMRQRDAESVSRAVLPKFYLENLNLHAFAALDSAGYRAVFTAVPRVMVEHFLKEYLAVDSVVGTELRCAGEFFTGLVSPAGLVVKHRAVKEMFGDKRPDVGIGASTLHDHFMISLCKESYVITREDNAKSSAIMPRSRYPKPLVFHDGRLAFLPTPAASLAMFLWLPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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