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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000677`

染色体: Chr04 坐标: 7741102-7747480 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000677`
名称	SmilChr04G000677
描述	transcription factor EMB1444-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7741102 - 7747480 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022546`
GeneID	`131022546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022546`
原始查询	`LOC131022546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor EMB1444-like
产物	transcription factor EMB1444-like
Arabidopsis	`AT2G27230` (LHW) transcription factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817265] identity=39.1; qcov=0.443; evalue=8.79e-49; confidence=low
Rice	`Os11g0158500` (OsbHLH151) - identity=49.7; qcov=0.312; evalue=3.34e-52; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF14215 (bHLH-MYC_N); PF23176 (bHLH_LHW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808037.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808037.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808037.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808037.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7743505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr4:7743734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr4:7745435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:7745658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:7746047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:7746442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C9,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808037.1

698 aa

349

698

bHLH-MYC_N

bHLH_LHW

PF14215 bHLH-MYC_N 6-182 aa PF23176 bHLH_LHW 519-572 aa

XP_057808038.1

612 aa

306

612

bHLH-MYC_N

bHLH_LHW

PF14215 bHLH-MYC_N 2-96 aa PF23176 bHLH_LHW 433-486 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808037.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	6	182	7.6e-32	111.8	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
`XP_057808037.1`	Pfam	`PF23176`	bHLH_LHW	Domain	519	572	7.3e-31	106.7	Transcription factor LHW bHLH domain
`XP_057808038.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	2	96	2.9e-14	54.5	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
`XP_057808038.1`	Pfam	`PF23176`	bHLH_LHW	Domain	433	486	6.1e-31	106.9	Transcription factor LHW bHLH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952054.1
CTCACTGTCTGGGCCATCAGCCCAATATTTATATTTTTTGAAGTAGACTTATATATAAACACATATTTACAAAGATGTATGCATATTTATATATTACTATTACTATATTTAATATAAACGAAAACTAGCTCTTAAAAGTCTTCCCACCAAAAAAGCAAAAGCCATCGCCTTGTTTCTCCATTAGATTCTCATTCTACTGTATCGTCCCAAAACCGACACCAAAATTCCAGTTCCATAGAGCTTAAATTTCTGTTTAATAA...

XM_057952055.1
TTGGATATGCAGTTGCTGAAATGTCGCGTTCTTCTCATGTAGTGGGGAAAGGGTAACTTAAATGATCTCTCTTCTTGCGTACAATTTATAATATTTATATTATATATTTATTACATTAACTTACTACTCTTACTCCTATGGGATGTGCATCATCATTTTGTTCTTTCCTCATCATGTTTGAGGTGTCATGAATGACCTATGTTCAGCAAAGAAAAGTGGCTCTGCACGTAAATGGGTGGTCGGGGAAGCAGCTTTCAAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022546
ATGGGGAGTAGATTCTTGCGGCCATTCCTCCAAACTCTTTGCTGCAATTCTCCTTGGAATTATGCAGTGTTCTGGAAGCTTAAGCATCAAGATGATATGATTTTGGCATGGGAAGATGGCTTTTGTGACATTTCAAAGCCAAGAGATGCCATGGTGAGCCCGGTAGAAGATTTGTACTTCAAAAGCTCAAATATGATTTTGTCATCGTCTCTAACACCAAGTCTGCTTGATGGAACTCCTGGCGACCATCTAGTTGGATA...

LOC131022546
ATGAATGACCTATGTTCAGCAAAGAAAAGTGGCTCTGCACGTAAATGGGTGGTCGGGGAAGCAGCTTTCAAGGGAAATGCTCGCTGGATATATGCAGACAGCATACAAACTGATGTTTTGAATTCCATTTTAGTTGCTAAGTATCCAGATGAATGGCTGCTTCAATTTGCGGCTGGCATAAAGACAATATTGCTTCTGCCTGTAATTCCTGATGGAGTTCTACAGCTTGGATCATTGGAAATGGTGGCTGAAGATGCAGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808037.1
MGSRFLRPFLQTLCCNSPWNYAVFWKLKHQDDMILAWEDGFCDISKPRDAMVSPVEDLYFKSSNMILSSSLTPSLLDGTPGDHLVGYAVAEMSRSSHVVGKGVVGEAAFKGNARWIYADSIQTDVLNSILVAKYPDEWLLQFAAGIKTILLLPVIPDGVLQLGSLEMVAEDAAVVVYLKNKFDTHKESDGYVSLMSTFMDYLEEPSTVTTEKVTEDQNYIHAVEDLYSIANQMVPVFKFQDLYNSSERHVEDNHENVAER...

XP_057808038.1
MNDLCSAKKSGSARKWVVGEAAFKGNARWIYADSIQTDVLNSILVAKYPDEWLLQFAAGIKTILLLPVIPDGVLQLGSLEMVAEDAAVVVYLKNKFDTHKESDGYVSLMSTFMDYLEEPSTVTTEKVTEDQNYIHAVEDLYSIANQMVPVFKFQDLYNSSERHVEDNHENVAEREMNQQWMGMIHVPEPCQLSYADYEDEISRFIHEERLRVSPHCYELNRRMCGDFVNELMDYNFEEGGTEPTSVGNDFDNAICESGSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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