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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000678`

染色体: Chr04 坐标: 7754387-7758299 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000678`
名称	SmilChr04G000678
描述	tropinone reductase homolog
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7754387 - 7758299 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022547`
GeneID	`131022547`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022547`
原始查询	`LOC131022547`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tropinone reductase homolog
产物	tropinone reductase homolog
Arabidopsis	`AT5G06060` (AT5G06060) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830493] identity=56.8; qcov=0.973; evalue=2.57e-104; confidence=high
Rice	`Os03g0268900` - identity=57.4; qcov=0.97; evalue=3.9e-101; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00960 (Tropane, piperidine and pyridine alkaloid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF01370 (Epimerase); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2); PF23441 (SDR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022547

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808039.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808039.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057808039.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808039.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7755562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,C60
`Chr4:7755650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:7755743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B28,B5,C2,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808039.1

264 aa

132

264

SDR

adh_short

Epimerase

adh_short_C2

PF23441 SDR 14-258 aa PF08659 KR 16-176 aa PF00106 adh_short 16-203 aa PF01370 Epimerase 17-182 aa PF13561 adh_short_C2 24-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808039.1`	Pfam	`PF23441`	SDR	Domain	14	258	1.6e-07	31.7	SDR-like rossmann domain
`XP_057808039.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	16	176	7.8e-15	56.0	KR domain
`XP_057808039.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	16	203	6e-49	166.9	short chain dehydrogenase
`XP_057808039.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	17	182	1.7e-05	25.1	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057808039.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	24	260	1.4e-52	179.4	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952056.1
AGAAAGTAATTAATTAAGCTAATGAATCGGGTTTAGTCGATTCACAAACTTTTGAGCCGAATGCTACAAACAAACATTAAATACAGAGACAAAATCTCCAACTCCCAACTAGCTAGGACGCCTTTGGTCGAACCCACTTTGTTCCAAAAATAATAAGTATCAACTCATCAACTTCATTTCAATTTGCTTACACCAAAAAACCAACTAAAACTAAGTTGCAGAAATCTCAACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022547
ATGGAGAGTTCCAACAGGCAGAAACGATGGAGTCTCGAAGGTATGACAGCACTCGTCACTGGTGGCACCAAAGGAATCGGATACGCCATTGTTGAAGAGCTTGCAGAATTTGGTGCAACGATTTATACATGTTCGAGAAATGGGTCTGAGCTTAGTGAAAGGCTGAAAGAATGGGAGGCAAAAGGGTTAAAGGTGAAGGGATCAGTGTGTGATTTGACGTCAAGAACTCAAAGAGAAGAACTCATCAAAAATGTTTCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808039.1
MESSNRQKRWSLEGMTALVTGGTKGIGYAIVEELAEFGATIYTCSRNGSELSERLKEWEAKGLKVKGSVCDLTSRTQREELIKNVSLEFDGKLNILINNAATSLLKHACDHTAEDFDGIMSSNLEAPYHITQLAHPLLKASGSANIVFISSVAGGIALPAMSAYAASKGAINQLTKNLACEWAKDNIRANAVAPFGVRTTIIKPEDVEMSILQMVAPLMARTHVRRIAEADEISPLVAFLCLPAASYITGQVIYVDGGYT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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