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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000683`

染色体: Chr04 坐标: 7959403-7963578 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000683`
名称	SmilChr04G000683
描述	transmembrane 9 superfamily member 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7959403 - 7963578 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022553`
GeneID	`131022553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022553`
原始查询	`LOC131022553`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane 9 superfamily member 5-like
产物	transmembrane 9 superfamily member 5-like
Arabidopsis	`AT1G08350` (AT1G08350) Endomembrane protein 70 protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837355] identity=51.1; qcov=0.944; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0237000` (OJ1081D05.4) - identity=50.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0072657 (protein localization to membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02990 (EMP70)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057808041.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057808042.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057808042.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057808041.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057808041.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7959598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:7959611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:7960071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:7960122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:7960142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:7960175`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A6,B106,B51,B54,B74,B84,B91,C14,C15,C28,C80,D5
`Chr4:7960341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:7960414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:7960604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:7961285`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A20,A3,A8,A9,B101,B105,B106,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B118,B12,B127,B128,B131,B134,B16,B2,B20,B22,B25,B27,B3,B30,B35,B37,B4,B41,B49,B51,B54,B55,B59,B6,B65,B66,B69,B73,B74,B77,B79,B84,B89,B91,C10,C14,C15,C18,C21,C22,C23,C27,C28,C30,C36,C37,C41,C43,C44,C48,C49,C5,C51,C57,C60,C61,C65,C67,C72,C76,C80,C81,D10,D4,D5,D7,D8
`Chr4:7961289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr4:7961618`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A3,B137,B41,B59,B69,C41,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808041.1

585 aa

292

585

EMP70

PF02990 EMP70 48-540 aa

XP_057808042.1

557 aa

278

557

EMP70

PF02990 EMP70 36-512 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808041.1`	Pfam	`PF02990`	EMP70	Family	48	540	2.4e-146	489.1	Endomembrane protein 70
`XP_057808042.1`	Pfam	`PF02990`	EMP70	Family	36	512	2.4e-140	469.3	Endomembrane protein 70

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952058.1
GAGTCCAACTCAAAGGTCAAAACAATTTGCAAGAGAAGAGAAGTAGACACCTACGAAAGCGTGCAAAACAGAAGCGCGATTTTATGCTGATAGTTAAAAGATTCACCGGCAAATAACCGTTGACCGTTATTTATCACGTGAATCCCGCCGCCCCGCCTCCGCCGCCCTCCGCCGTGCGGAGTTCAAGAGCAGTGCACATTCGAGATCACGGGAGAATGGGAATTTTGAAATCTGCTTTTGTGACTGCTCTGTTACTCCTG...

XM_057952059.1
GTCAAAACAATTTGCAAGAGAAGAGAAGTAGACACCTACGAAAGCGTGCAAAACAGAAGCGCGATTTTATGCTGATAGTTAAAAGATTCACCGGCAAATAACCGTTGACCGTTATTTATCACGTGAATCCCGCCGCCCCGCCTCCGCCGCCCTCCGCCGTGCGGAGTTCAAGAGCAGTGCACATTCGAGATCACGGGAGAATGGGAATTTTGAAATCTGCTTTTGTGACTGCTCTGTTACTCCTGCTGCCTATCACTCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022553
ATGGGAATTTTGAAATCTGCTTTTGTGACTGCTCTGTTACTCCTGCTGCCTATCACTCTTGATTGCGCCAACACCTACAATGCCGGAGATCGCGTGCCCCTTTTCGTCAACAAAATCGGCCCCCTTCACAACCCTAGTGAAACGTATGAATATTACAAGTTGGCCTTCTGTCGTCCAGATCAGGTGATTGAAAAGAAGGAAAGCTTTGGGGAAGTTTTGGGTGGTGATCGATTGGCAAATGCTCTATATGATTTGAGATT...

LOC131022553
ATGCCGGAGATCGCGTGCCCCTTTTCGTCAACAAAATCGGCCCCCTTCACAACCCTAGTGAAACGTATGAATATTACAAGTTGGCCTTCTGTCGTCCAGGTGATTGAAAAGAAGGAAAGCTTTGGGGAAGTTTTGGGTGGTGATCGATTGGCAAATGCTCTATATGATTTGAGATTTGCATTGAACAAAACCCGAGACGCTGTTTGCCAAAAGAAGCTAACTAAGGGCGATATTGCAAAATTCAGGGATGCTATCGCCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808041.1
MGILKSAFVTALLLLLPITLDCANTYNAGDRVPLFVNKIGPLHNPSETYEYYKLAFCRPDQVIEKKESFGEVLGGDRLANALYDLRFALNKTRDAVCQKKLTKGDIAKFRDAIANDFYYQMYYDDRPLWAYIGKIEDESWKVDGKEKKFLLFTHVHFDALYNGNQVIEINAFSEPSHLVDVTEDVDVEVEFTYSISWKRTSMPYKNRMGKYARASLLHILQQSHWFSFVNSIIIVILLIGLLTLLLLQHLKNDLRKWSIG...

XP_057808042.1
MPEIACPFSSTKSAPFTTLVKRMNITSWPSVVQVIEKKESFGEVLGGDRLANALYDLRFALNKTRDAVCQKKLTKGDIAKFRDAIANDFYYQMYYDDRPLWAYIGKIEDESWKVDGKEKKFLLFTHVHFDALYNGNQVIEINAFSEPSHLVDVTEDVDVEVEFTYSISWKRTSMPYKNRMGKYARASLLHILQQSHWFSFVNSIIIVILLIGLLTLLLLQHLKNDLRKWSIGDEDEEKEVGWKYIHGDVFRCPTNLPLFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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