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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000682`

染色体: Chr04 坐标: 7956072-7958512 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000682`
名称	SmilChr04G000682
描述	cytochrome b-c1 complex subunit 9
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7956072 - 7958512 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022554`
GeneID	`131022554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022554`
原始查询	`LOC131022554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b-c1 complex subunit 9
产物	cytochrome b-c1 complex subunit 9
Arabidopsis	`AT3G52730` (AT3G52730) ubiquinol-cytochrome C reductase UQCRX/QCR9-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824439] identity=65.3; qcov=1; evalue=2.69e-29; confidence=medium
Rice	`Os05g0400400` - identity=67.2; qcov=0.847; evalue=2.54e-26; confidence=medium
GO	GO:0005750 (GO:0005750); GO:0006122 (mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05365 (UCR_UQCRX_QCR9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057808043.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057808043.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057808043.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808043.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808043.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7956364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr4:7957746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B52
`Chr4:7958040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B107,B122,B98,C48
`Chr4:7958066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808043.1

72 aa

UCR_UQCRX_QCR9

PF05365 UCR_UQCRX_QCR9 15-63 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808043.1`	Pfam	`PF05365`	UCR_UQCRX_QCR9	Family	15	63	6.3e-18	65.1	Cytochrome b-c1 complex subunit 9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952060.1
AAAGAAACGCAAATAAACACCAGCACGCATCAAAACAAATCCAAGGGGAATTCTGCAAACAACAAAAAGTAGGAATAAAGGAGTGTGTAAAACGACTATTAGTACGACAAAACAAAAAAAAAGTATCTCAAAACTGTGTTTATCCCTACCTCCCATACATATGCTAATAAATGGGCCGGCTAAGCATAGCAGAAATTTTGGGCTCGGCCCACTAAACCAACAAGCTCGAAATCCCTGTAGAAAAGTTCTAGGAATCAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022554
ATGGAACCGGCGGTTAAGAAGAGGGGCGGCGGCGTGTGGGAGGGTATGTATAGATTGGTCATGCGCCGCACTCCGGTCTATGTCACCTTCGTCATCGCCGGCGCTTTTCTCGGTGAACGCGCTGTGGACCGTGGAATTCGTGCTCTATGGGACCACGTCAACGTTGGGAAACGGTACGAGGATATTTCGGTTCTGGGTCAGAGACAGTCTGAAGAGTGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808043.1
MEPAVKKRGGGVWEGMYRLVMRRTPVYVTFVIAGAFLGERAVDRGIRALWDHVNVGKRYEDISVLGQRQSEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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