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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000693`

染色体: Chr04 坐标: 8077173-8080520 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000693`
名称	SmilChr04G000693
描述	uncharacterized SmilChr04G000693
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8077173 - 8080520 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022563`
GeneID	`131022563`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022563`
原始查询	`LOC131022563`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=27.4; qcov=0.702; evalue=7.97e-60; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=34.3; qcov=0.704; evalue=3.43e-99; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022563

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808056.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808056.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808056.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808056.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8077767`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A25,A5,B105,B139,B23,B27,B30,B32,B39,B5,B51,B6,B98,C1,C11,C12,C26,C55,C67,C69,C70,C80
`Chr4:8077772`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B88,D7
`Chr4:8077772`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B88,D7
`Chr4:8077805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C48
`Chr4:8077828`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	150	A1,A10,A11,A16,A18,A2,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A7,B1,B10,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B112,B114,B115,B119,B120,B124,B125,B126,B127,B129,B131,B136,B17,B19,B20,B22,B24,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B48,B49,B5,B53,B55,B56,B61,B63,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B86,B87,B91,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C10,C13,C15,C16,C17,C21,C22,C23,C25,C26,C28,C30,C33,C34,C36,C38,C39,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C58,C60,C62,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C86,C9,D10,D11,D2,D4,D5
`Chr4:8077846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:8077854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B44
`Chr4:8077854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:8077868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,C12,C4,C50,C64
`Chr4:8077881`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	119	A1,A10,A14,A15,A2,A23,A4,A7,A8,B10,B100,B102,B103,B105,B108,B109,B110,B113,B117,B118,B119,B120,B122,B126,B13,B130,B131,B134,B137,B139,B14,B16,B18,B19,B21,B22,B23,B24,B26,B3,B30,B34,B36,B4,B40,B46,B47,B49,B50,B52,B54,B59,B6,B60,B61,B63,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B78,B79,B8,B81,B84,B86,B87,B9,B90,B92,B94,C12,C15,C16,C21,C26,C28,C29,C30,C34,C35,C4,C40,C41,C43,C46,C5,C52,C53,C55,C58,C59,C6,C60,C61,C64,C65,C66,C67,C7,C70,C72,C74,C78,C79,C8,C81,C87,C9,D10,D2,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr4:8077883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C38,C75
`Chr4:8077884`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	117	A1,A10,A14,A15,A2,A23,A4,A7,A8,B10,B100,B102,B103,B105,B108,B110,B113,B117,B118,B119,B120,B122,B126,B13,B130,B131,B134,B137,B139,B14,B16,B18,B19,B21,B22,B23,B24,B26,B3,B30,B34,B36,B4,B40,B46,B47,B49,B50,B52,B54,B59,B6,B60,B61,B63,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B78,B79,B8,B81,B86,B87,B9,B90,B92,C12,C15,C16,C21,C26,C28,C29,C34,C35,C4,C40,C41,C42,C43,C46,C5,C52,C53,C55,C58,C59,C6,C60,C61,C64,C65,C66,C67,C7,C70,C72,C73,C74,C78,C79,C8,C81,C87,C9,D10,D2,D5,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808056.1

828 aa

414

828

DBD_Tnp_Mut

MULE

SWIM

PF03108 DBD_Tnp_Mut 241-303 aa PF10551 MULE 438-533 aa PF04434 SWIM 688-713 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808056.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	241	303	7.3e-07	29.5	MuDR family transposase
`XP_057808056.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	438	533	2.1e-18	67.2	MULE transposase domain
`XP_057808056.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	688	713	2.7e-05	24.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952073.1
TCTTGAAGAGAATGTTTTATGTTCACATGACGTTTCTGTTTAGATTGAAATGGTGCTTGCTCTAATACCCTGTTTATGGTAATTTATCATTGCAGAGTATGTCTAGTCTGTTGGTTAGACTTAGGATATGGTATGATGGGAAGTTTGTTGGTAATAATCAATATGTAGAAAAACTGTGTTTGGACATTCCTGAATATGATGTGTTCGAGTTTGAGGAGGCATTTGTGCATGAGGTGTTGGGTGCTGATTTGGGGTGTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022563
ATGTCTAGTCTGTTGGTTAGACTTAGGATATGGTATGATGGGAAGTTTGTTGGTAATAATCAATATGTAGAAAAACTGTGTTTGGACATTCCTGAATATGATGTGTTCGAGTTTGAGGAGGCATTTGTGCATGAGGTGTTGGGTGCTGATTTGGGGTGTGAGAGTATGTCTAGGTATGCATTCAAAGATAAAGAGACTGGTGAGTTCACATTTGTGAATGTTGATGATGAAGAAACTGACTTTGTTAGTCTAGCATTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808056.1
MSSLLVRLRIWYDGKFVGNNQYVEKLCLDIPEYDVFEFEEAFVHEVLGADLGCESMSRYAFKDKETGEFTFVNVDDEETDFVSLALKFVDEKKNLEILCECNTAVAEVAEVEKIADKIDDKTLEDDHDEELEDSDWELFENVVEDGTDSSDDGLEESDFSDEDDKFLEARRTKERPSKKEKIVEEKGKSILHESSTIPSTLVVLPNEDEFDSDASCESLDDDGNIKPKSKLYSKNIPFNDVKLELVMRFKDAKECQDVVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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