Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000732`

染色体: Chr04 坐标: 8697127-8700156 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000732`
名称	SmilChr04G000732
描述	kinesin-like protein KIN-13B
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8697127 - 8700156 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022587`
GeneID	`131022587`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022587`
原始查询	`LOC131022587`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kinesin-like protein KIN-13B
产物	kinesin-like protein KIN-13B
Arabidopsis	`AT3G16060` (AT3G16060) ATP binding microtubule motor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820851] identity=34.3; qcov=0.971; evalue=3.02e-11; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022587

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808083.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808083.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808083.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808083.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808083.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8699102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:8699171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,D10
`Chr4:8699175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:8699221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr4:8699239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr4:8699280`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	74	A14,A16,A21,A3,A4,A9,B10,B107,B110,B114,B117,B12,B124,B128,B129,B13,B130,B136,B16,B27,B3,B32,B37,B42,B43,B45,B46,B50,B63,B64,B67,B71,B75,B78,B81,B83,B85,B91,B94,B95,C19,C2,C21,C25,C26,C27,C30,C31,C32,C33,C38,C39,C45,C48,C50,C51,C52,C53,C55,C58,C68,C76,C78,C81,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D3,D8,D9
`Chr4:8699455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B136,B22,C15,C4
`Chr4:8699471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:8699557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101347.1
AAAATAAAAATTGTCCACTAAGATAAAAATAATAAAAACTATCCATTTTTTTATTGAAAAGACAAAAATACCCCTTACTTTAAAATTTAAAAAAATGACCACTCATTTCTCTCACTCTCCACCTTCACGTCTCTCTCTCTCTTCCTCTCCTTCTCGTCCTCGCCGCCCTCCACAGTTGCCGCCCACCACCACCGCTACACTGCTGTTCTGAGACGAAGGGAGCGGCGCACGCGGCAGCGTTGCTCCGCCACTGCTGACTC...

XM_057952100.1
ATGACCACTCATTTCTCTCACTCTCCACCTTCACGTCTCTCTCTCTCTTCCTCTCCTTCTCGTCCTCGCCGCCCTCCACAGTTGCCGCCCACCACCACCGCTACACTGCTGTTCTGAGACGAAGGGAGCGGCGCACGCGGCAGCGTTGCTCCGCCACTGCTGACTCGCCGGGGAAGAAGACGCTCTTCTGGCTCGGCACCTTTGACTCCGCCGCGCCGCCTCCCCCAGTCCGACGCTCCGCCTTCCCCGGTCCGACGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022587
ATGAATGCGGTGGGAAGGCAGAGATCCGGCGCGGCGGCGGCGGTAGTACTCCGACCAATTCGTGGAAGCTTCATCGAACGGCCGATGGCTGCAATCAGCTGGCCTGCAGCATCTACAGTCATCGAACAATGCGGTTCCTCCAGCTCAGGATTTTGGATATTACAATGGAGGCGGTCAGGTTCGATAATGTACAGTAGTGTGCAGGCGCAGAGGACGTACAGTGGAGGCGATTTGTTTGCGGAGCCGTTGACGCCGCCAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808083.1
MNAVGRQRSGAAAAVVLRPIRGSFIERPMAAISWPAASTVIEQCGSSSSGFWILQWRRSGSIMYSSVQAQRTYSGGDLFAEPLTPPGHSRRKNGEELVSPNESSPGLLDLHSFDTELLPEGVIVANRCQFPVCMMPIQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器