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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000736`

染色体: Chr04 坐标: 8821774-8824645 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000736`
名称	SmilChr04G000736
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8821774 - 8824645 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022591`
GeneID	`131022591`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022591`
原始查询	`LOC131022591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.5-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.5-like
Arabidopsis	`AT2G38100` (AT2G38100) proton-dependent oligopeptide transport (POT) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818388] identity=33; qcov=0.975; evalue=7.82e-78; confidence=low
Rice	`Os03g0823500` (OSJNBb0081B07.12) - identity=28.5; qcov=0.944; evalue=3.88e-49; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022591

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057808087.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808087.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808087.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808087.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8822046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D7,D8
`Chr4:8822062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,C17,C30,C51
`Chr4:8822085`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A11,B102,B11,B127,B129,B130,B131,B30,B33,B45,B46,B53,B57,B78,B81,C17,C26,C30,C51,C55,C67,C74,C84
`Chr4:8822088`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A11,B102,B11,B127,B129,B130,B131,B30,B33,B45,B46,B53,B57,B78,B81,C17,C26,C30,C51,C55,C67,C74,C84
`Chr4:8822117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B57,C55
`Chr4:8822132`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A10,B102,B11,B127,B129,B130,B131,B30,B45,B53,B56,B57,B61,B81,B96,B99,C27,C33,C55,C67,C74
`Chr4:8822158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:8822162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:8822169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:8822225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr4:8822259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B96,C27,D10
`Chr4:8822260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808087.1

569 aa

284

569

PTR2

PF00854 PTR2 198-498 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808087.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	198	498	5.6e-31	108.5	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952104.1
GTTTGGCTCTTTGTCAATGCAAAGTCTTGGTCAACTGCATTACTATATTGTACTTTGGTAGTTACATGTGAACAATTAGATAGAAAATTAGAAAGAAAATCTAGGAATCTGGGGAAGCTTCGTGTTGGCTTCTAGCTAGGTAAAGATCATAAAGCTCGCATTTGGAGTGGTCCTTACTTTAATTGAGAAGTGATTTGAAACAATGGTGAAGAAGGAGAAGGAGAGATTCGTCAGAATTAGTGCTCTGCTATGGGCAGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022591
ATGGTGAAGAAGGAGAAGGAGAGATTCGTCAGAATTAGTGCTCTGCTATGGGCAGACATACTGGTGGCCTACGCCCTCTTCGTGATGCAAAACTATCTCACCGAGGTCTGGGGAATAAGTTTGGTCCACGCCGCCCTCATCTTGAACATCTGGAACGGAGTTTACCGGATGTTGCCGGTTTTCTTCCTCTACTTGGTCCACGCATTCCTCGGCAACTTCAAGCTCCTCGTCCTCACCAGCTTATCTTACACCGCGGGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808087.1
MVKKEKERFVRISALLWADILVAYALFVMQNYLTEVWGISLVHAALILNIWNGVYRMLPVFFLYLVHAFLGNFKLLVLTSLSYTAGITMVAVSTPPLAHATGTCKRYKPECVGSAQKGLLIAGLALIAVGVAGNLISVKPFLLQQRAGGSSHNSASGSSTATASAARKAEPHQLLGLIGVVVVGIAGAIALPYIRPRTLKFGIPAICTAFGTFLFLTGSRGYKKDRQVKESPLCIVCRVLVAASLKSFRSYPDGNDRYHG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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