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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001998`

染色体: Chr01 坐标: 35470632-35476461 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001998`
名称	SmilChr01G001998
描述	putative axial regulator YABBY 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35470632 - 35476461 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022595`
GeneID	`131022595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022595`
原始查询	`LOC131022595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative axial regulator YABBY 2
产物	putative axial regulator YABBY 2
Arabidopsis	`AT1G08465` (YAB2) Plant-specific transcription factor YABBY family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766682] identity=60.7; qcov=1.03; evalue=1.13e-77; confidence=high
Rice	`Os07g0160100` (YAB1) - identity=57.8; qcov=0.87; evalue=8.73e-62; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0007275 (multicellular organism development); GO:0045165 (cell fate commitment)
KEGG	-
Pfam	PF04690 (YABBY); PF09011 (HMG_box_2); PF24868 (YABBY_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808092.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057808092.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808092.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808092.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808092.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35471071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C74
`Chr1:35473098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C3
`Chr1:35473128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr1:35473148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808092.1

187 aa

187

YABBY_N

YABBY

HMG_box_2

PF24868 YABBY_N 7-62 aa PF04690 YABBY 99-160 aa PF09011 HMG_box_2 110-153 aa

XP_057808099.1

185 aa

185

YABBY_N

YABBY

HMG_box_2

PF24868 YABBY_N 7-62 aa PF04690 YABBY 97-158 aa PF09011 HMG_box_2 108-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808092.1`	Pfam	`PF24868`	YABBY_N	Domain	7	62	3.1e-27	94.6	YABBY, N-terminal
`XP_057808092.1`	Pfam	`PF04690`	YABBY	Domain	99	160	1.6e-37	128.4	YABBY protein, C-terminal
`XP_057808092.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	110	153	6.2e-05	24.3	HMG-box domain
`XP_057808099.1`	Pfam	`PF24868`	YABBY_N	Domain	7	62	3.1e-27	94.6	YABBY, N-terminal
`XP_057808099.1`	Pfam	`PF04690`	YABBY	Domain	97	158	1.5e-37	128.5	YABBY protein, C-terminal
`XP_057808099.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	108	151	4.5e-05	24.8	HMG-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952116.1
AATACCAAAAACCACATCACTCCCACCCACTCATTCTCTCAATCATAATACCCCCTACAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCTCTAAAATTCTACTTCTCTCGCTCTCTCTCCCCAAAACATCTTTCCATAAATAAAAAACCATCCTTTTCTTTTCACAAAACCCATTACAAAATACCACTAAAATTTCGTACTCCCACTTCACACACACACACACACACACACACACACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT...

XM_057952109.1
AATACCAAAAACCACATCACTCCCACCCACTCATTCTCTCAATCATAATACCCCCTACAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCTCTAAAATTCTACTTCTCTCGCTCTCTCTCCCCAAAACATCTTTCCATAAATAAAAAACCATCCTTTTCTTTTCACAAAACCCATTACAAAATACCACTAAAATTTCGTACTCCCACTTCACACACACACACACACACACACACACACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022595
ATGTCAATGGAATTGACCGCCGAGCCTGTTTGTTATGTTAACTGCAACTACTGCAACACCATTTTGGCGGTAAATGTTCCATTTGGGAGCATGTTCACTATTGTGACTGTGAGATGTGGGCATTGCTCAAATTTGCTTCCAGTCAATATGGGAGCTTTGCTTCAGTCTGTTCACCTCCAAGATTTCCAGAAACAACAATCCTTGGCGGCGGCCGGCATCGACGCCGCCACCACTAGAGACAACGGCTCGTCTTCAAATCG...

LOC131022595
ATGTCAATGGAATTGACCGCCGAGCCTGTTTGTTATGTTAACTGCAACTACTGCAACACCATTTTGGCGGTAAATGTTCCATTTGGGAGCATGTTCACTATTGTGACTGTGAGATGTGGGCATTGCTCAAATTTGCTTCCAGTCAATATGGGAGCTTTGCTTCAGTCTGTTCACCTCCAAGATTTCCAGCTCCAGAAACAACAATCCTTGGCGGCGGCCGGCATCGACGCCGCCACCACTAGAGACAACGGCTCGTCTTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808092.1
MSMELTAEPVCYVNCNYCNTILAVNVPFGSMFTIVTVRCGHCSNLLPVNMGALLQSVHLQDFQLQKQQSLAAAGIDAATTRDNGSSSNRNRYASLQVDTEQPKMAPIRPPEKRQRVPSAYNRFIKEEIQRIKASNPEISHREAFSTAAKNWAHFPHIHFGLKMEGNKQAKLDHPVAGEATAQKSLGF

XP_057808099.1
MSMELTAEPVCYVNCNYCNTILAVNVPFGSMFTIVTVRCGHCSNLLPVNMGALLQSVHLQDFQKQQSLAAAGIDAATTRDNGSSSNRNRYASLQVDTEQPKMAPIRPPEKRQRVPSAYNRFIKEEIQRIKASNPEISHREAFSTAAKNWAHFPHIHFGLKMEGNKQAKLDHPVAGEATAQKSLGF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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