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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000746`

染色体: Chr04 坐标: 9148720-9150157 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000746`
名称	SmilChr04G000746
描述	uncharacterized SmilChr04G000746
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	9148720 - 9150157 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022600`
GeneID	`131022600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022600`
原始查询	`LOC131022600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=37.4; qcov=1; evalue=2.45e-38; confidence=medium
Rice	`Os11g0577650` - identity=64.3; qcov=0.708; evalue=6.03e-67; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808097.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057808097.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057808097.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808097.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808097.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:9149175`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	55	A10,A19,A21,A24,A25,A4,A5,B100,B105,B109,B114,B117,B123,B129,B131,B136,B138,B14,B15,B21,B29,B37,B42,B43,B49,B56,B57,B62,B72,B76,B8,B82,B83,B85,B87,B88,B9,B90,B92,B93,B97,C29,C40,C43,C49,C56,C71,C72,C8,C80,C81,C82,D10,D2,D9
`Chr4:9149178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:9149184`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A7,B107,B124,B126,B24,B51,B54,B59,B8,B84,B91,C14,C47,C52,C70,C83,D11,D3
`Chr4:9149204`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A2,A20,A23,A24,A4,B119,B121,B138,B18,B21,B25,B78,B80,B97,C31,C36,C47,C64,C66,C86
`Chr4:9149222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:9149236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C82
`Chr4:9149236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:9149237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B15,B91,C82
`Chr4:9149239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	59	A21,A24,A25,A5,B104,B105,B114,B117,B123,B129,B131,B136,B138,B14,B15,B21,B22,B26,B29,B36,B37,B47,B49,B56,B57,B60,B61,B68,B72,B74,B82,B83,B88,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,C23,C28,C29,C40,C43,C44,C49,C51,C55,C56,C57,C7,C71,C73,C76,C8,C81,C82,D2
`Chr4:9149274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B79,D1
`Chr4:9149338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B67,C57,C64,C66,C85
`Chr4:9149450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808097.1

202 aa

101

202

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 1-38 aa PF01609 DDE_Tnp_1 66-200 aa PF13359 DDE_Tnp_4 70-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808097.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	1	38	4.4e-09	36.8	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057808097.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	66	200	4.1e-06	27.4	Transposase DDE domain
`XP_057808097.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	70	202	4.3e-22	79.1	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952114.1
AGTAGGATATGAAATAAACAAGAAAACATGTTATATCTTTGTGCCCATATTTTACTATGACTTGTGTGATAACTTGTGTGATAACTTTCTTGTTAGGTTTTCACTATGACTCGTCTTATGCGATCGGTAGGGAGGATAAGAAGGTTTAAACAACTTCAATTAGTTAGTATAATGGTTGTGATAGTGTTGATGATGCAATGGGTTTGGAATATGATAAGTGTTGCTACAATTAAGGGTATTCAATTGAGGTCAAGGAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022600
ATGTTTCTATACACATTGGCTCACCATAAGAAAAATAGGTCAGTTGGGCAGTTTTTTTTTAGAAGTGGAGAAACTATTAGTCGACAATTTAATCTTTGTTTGAGGGCTTTGCTAAAGTTGCATGAATATTTACTTCACAAGCCAACTCCAATTTCTGATGATTGTGAAGACGATAGGTGGAAACCTTTCAATAATTGTTTAGGAGCCTTAGATGGCACTTACATCAATGTAAGAGCACCTTCACAAGAACGGGGAAAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808097.1
MFLYTLAHHKKNRSVGQFFFRSGETISRQFNLCLRALLKLHEYLLHKPTPISDDCEDDRWKPFNNCLGALDGTYINVRAPSQERGKYRIRKGTISMNVLGVCAPNMEYIYVLPGWKGSAHDVRVLRNALSRPNGFRVPRGNYYLADAGYTNYEGFLTPYRGQRYHLKEWTDRHPESAEEYYNLKHARARNVIERCFGLLKGR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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