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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000619`

染色体: Chr01 坐标: 13648121-13649086 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000619`
名称	SmilChr01G000619
描述	uncharacterized SmilChr01G000619
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	13648121 - 13649086 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022621`
GeneID	`131022621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022621`
原始查询	`LOC131022621`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=30.3; qcov=0.452; evalue=1.6e-19; confidence=low
Rice	`Os09g0268800` - identity=27.7; qcov=0.349; evalue=8.49e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808146.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808146.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808146.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057808146.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808146.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:13648126`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	75	A1,A13,A16,A19,A20,A25,A4,A6,A7,B101,B110,B112,B115,B12,B120,B121,B122,B124,B126,B127,B129,B13,B130,B133,B137,B14,B17,B2,B21,B29,B30,B34,B4,B44,B46,B47,B50,B52,B54,B64,B72,B74,B78,B80,B81,B84,B89,B94,C1,C10,C13,C16,C19,C20,C22,C23,C27,C29,C30,C33,C37,C47,C50,C52,C59,C70,C71,C73,C81,C82,C87,C9,D1,D10,D5
`Chr1:13648130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C15
`Chr1:13648136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C15
`Chr1:13648140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C15
`Chr1:13648175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:13648225`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C12,C25
`Chr1:13648225`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C12,C25
`Chr1:13648232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C25
`Chr1:13648233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C25
`Chr1:13648244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C25
`Chr1:13648255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr1:13648259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808146.1

321 aa

160

321

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 102-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808146.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	102	148	9.8e-07	29.0	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952163.1
ATGGGAAAAGGATATTATACATTGAAATTCCATACTAAGGAGGATAAAGCGACTGCGAAAGCTCATCTTATTTGGGACCTTCCTGCGGGTTCTTTGAGGCTCCGTGATTGGGTTCATTTTTCCAATCCTTACAAGGAATCGTCCTCTTTAGCTCAGGTTTGGGTCAGAATTTATTATTTACCTGTGGAATTCTGGCACCCCGAAGTTCTATCTGGCATCGGATTTTGGCTAGGTCAATCGCTGAAAATTGATGGTAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022621
ATGGGAAAAGGATATTATACATTGAAATTCCATACTAAGGAGGATAAAGCGACTGCGAAAGCTCATCTTATTTGGGACCTTCCTGCGGGTTCTTTGAGGCTCCGTGATTGGGTTCATTTTTCCAATCCTTACAAGGAATCGTCCTCTTTAGCTCAGGTTTGGGTCAGAATTTATTATTTACCTGTGGAATTCTGGCACCCCGAAGTTCTATCTGGCATCGGATTTTGGCTAGGTCAATCGCTGAAAATTGATGGTAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808146.1
MGKGYYTLKFHTKEDKATAKAHLIWDLPAGSLRLRDWVHFSNPYKESSSLAQVWVRIYYLPVEFWHPEVLSGIGFWLGQSLKIDGNSIDDDVAHFTRILVEIDLAQPLPENMTIDGGDYSFNIEFSYEYFPLFCTRCRITGHSVDKCRRGKKEAKQPEEIVKPKEPEWQVVGKVNDHSLDKSLDAREGLVTVDDYDGEPDEQRQQPSGPDMLQALCKDLRAPGANRFNVLDGMETIDLDDAQGRDELPQAMVAKRDADSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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