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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000781`

染色体: Chr04 坐标: 9582246-9584636 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000781`
名称	SmilChr04G000781
描述	clathrin light chain 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	9582246 - 9584636 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022629`
GeneID	`131022629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022629`
原始查询	`LOC131022629`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clathrin light chain 2-like
产物	clathrin light chain 2-like
Arabidopsis	`AT3G51890` (AT3G51890) Clathrin light chain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824352] identity=50.4; qcov=0.737; evalue=1.78e-57; confidence=high
Rice	`Os04g0679100` - identity=58.4; qcov=0.473; evalue=3.49e-40; confidence=medium
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0030130 (clathrin coat of trans-Golgi network vesicle); GO:0030132 (clathrin coat of coated pit); GO:0032050 (clathrin heavy chain binding); GO:0048268 (clathrin coat assembly); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF01086 (Clathrin_lg_ch)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808119.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057808119.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808119.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808119.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808119.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:9582427`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	29	A25,B117,B119,B123,B124,B129,B131,B14,B16,B21,B28,B71,B76,B82,B93,B95,B97,C26,C32,C39,C43,C44,C46,C49,C51,C52,C62,C68,C76
`Chr4:9582651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:9584105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,D6
`Chr4:9584139`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B25
`Chr4:9584139`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B25
`Chr4:9584167`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A7,B105,B128,B25,B81,C28,C4,C65
`Chr4:9584380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C82,C9
`Chr4:9584440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:9584474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808119.1

315 aa

158

315

Clathrin_lg_ch

PF01086 Clathrin_lg_ch 149-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808119.1`	Pfam	`PF01086`	Clathrin_lg_ch	Family	149	280	3e-10	41.2	Clathrin light chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952136.1
TCTGACATGGCAAAGCACTATTGGCTACTCGCGAGCGCACAAGCGGAGCAGCGGCATGTACTACCTTTTCACCTGAGCCTGGTCGCATGCAATCGCCGCTCGATGCATACATGTATTGAATATCTCACTTTCTTTCAACGAAAACGAAGAGACGACCAATCCCAGTCGTCGGCGACATCGCTAGATAGAGAGATGTCATCAGAGTTTATTATCAGTGAAGACTCGGCGCGGCTCGGCTACGGCTCCCGGCTATCATCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022629
ATGGCAAAGCACTATTGGCTACTCGCGAGCGCACAAGCGGAGCAGCGGCATGTACTACCTTTTCACCTGAGCCTGGTCGCATGCAATCGCCGCTCGATGCATACATGTATTGAATATCTCACTTTCTTTCAACGAAAACGAAGAGACGACCAATCCCAGTCGTCGGCGACATCGCTAGATAGAGAGATGTCATCAGAGTTTATTATCAGTGAAGACTCGGCGCGGCTCGGCTACGGCTCCCGGCTATCATCGCAGCGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808119.1
MAKHYWLLASAQAEQRHVLPFHLSLVACNRRSMHTCIEYLTFFQRKRRDDQSQSSATSLDREMSSEFIISEDSARLGYGSRLSSQRFDSSRFDSFIDYTNEDHHEGGLEEYLDTSPHGGGYVAAPPPAEVVVSEAGEFAAKGPTLPPPAEKGFALGEWRRQNAIRLEEKERKEKETLKAIIEEADEYKAEFYRKWKIKRENSKALSREREKKFLEGREKFHAEADKSFWKAIAELIPREVPLMENKEKKPPTIVVIQGPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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