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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000845`

染色体: Chr04 坐标: 10688199-10689450 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000845`
名称	SmilChr04G000845
描述	uncharacterized SmilChr04G000845
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10688199 - 10689450 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022680`
GeneID	`131022680`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022680`
原始查询	`LOC131022680`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0468800; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os05g0468800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G01300` (AT5G01300) PEBP (phosphatidylethanolamine-binding protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830983] identity=58.9; qcov=0.97; evalue=1.09e-66; confidence=high
Rice	`Os05g0468800` - identity=63.8; qcov=0.97; evalue=3.19e-72; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01161 (PBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022680

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808177.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057808177.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808177.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808177.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808177.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10688335`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B31
`Chr4:10688335`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B31
`Chr4:10688353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B58,C51
`Chr4:10688398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B82,B94,C74,C82
`Chr4:10688409`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B107,B130,C87
`Chr4:10688409`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B107,B130,C87
`Chr4:10688414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:10688431`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,C42
`Chr4:10688431`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B41,C42
`Chr4:10688438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B124,B79
`Chr4:10688441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B108,B27,C43
`Chr4:10688457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808177.1

168 aa

168

PBP

PF01161 PBP 15-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808177.1`	Pfam	`PF01161`	PBP	Domain	15	165	2.8e-28	99.9	Phosphatidylethanolamine-binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952194.1
ATAAAACATCAACCTCATCATTTTTCTCTTCCACATCAATATCCTAATCCTAAATCAAACTCATCATCCCCTCCGAGAAAAACAAGAGAGAATAAAAAAAATTCAACCAAAGCAAGAAAAAAATGGCGAATTCAAGCGAGGAATTCCGGTTAGCGCTGCCGGGCGTGAGCCACGACGGACGATTGCCCCGCCAATACCTGGCGGAGGGACAGGGGGCGAAAAAAAATATTTCGCCCCCCGTTGAATGGTACAACGTGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022680
ATGGCGAATTCAAGCGAGGAATTCCGGTTAGCGCTGCCGGGCGTGAGCCACGACGGACGATTGCCCCGCCAATACCTGGCGGAGGGACAGGGGGCGAAAAAAAATATTTCGCCCCCCGTTGAATGGTACAACGTGCCAGAGGGGGCCAAGAACCTGGCCCTCGTGGTGCGGGACATTGACGCGCCCGACCCTGAGGGCCCCCTCGTCCCGTTCAATATCTGGGTGGTGGCCGGCATCCCGCCGGCGATCAAGGGGCTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808177.1
MANSSEEFRLALPGVSHDGRLPRQYLAEGQGAKKNISPPVEWYNVPEGAKNLALVVRDIDAPDPEGPLVPFNIWVVAGIPPAIKGLPEGFSGKEEEAGGEYAGIKEGTNDLKKHGWQTPKMPTPGHRIEFKLLALDQELNLGNKVTADKLLESSEGHVLGEAVFIVKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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