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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000853`

染色体: Chr04 坐标: 10797413-10801269 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000853`
名称	SmilChr04G000853
描述	importin subunit beta-1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10797413 - 10801269 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022687`
GeneID	`131022687`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022687`
原始查询	`LOC131022687`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	importin subunit beta-1-like
产物	importin subunit beta-1-like
Arabidopsis	`AT5G53480` (AT5G53480) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835429] identity=60.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0353400` (OsImpbeta1) - identity=68; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0008139 (nuclear localization sequence binding); GO:0031267 (small GTPase binding); GO:0061608 (nuclear import signal receptor activity)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03810 (IBN_N); PF13513 (HEAT_EZ); PF25574 (TPR_IMB1); PF25780 (TPR_IPO5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022687

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808181.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808181.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057808181.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808181.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808181.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10798576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr4:10798610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B83,C59
`Chr4:10798691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C79
`Chr4:10798752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr4:10798955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:10799375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:10799601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:10799742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B108,B27,C43
`Chr4:10800308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:10800843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B119
`Chr4:10800870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B83,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808181.1

875 aa

438

875

IBN_N

TPR_IPO5

HEAT_EZ

TPR_IMB1

PF03810 IBN_N 23-103 aa PF25780 TPR_IPO5 107-266 aa PF13513 HEAT_EZ 382-437 aa PF25574 TPR_IMB1 460-836 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808181.1`	Pfam	`PF03810`	IBN_N	Repeat	23	103	8.4e-12	45.6	Importin-beta N-terminal domain
`XP_057808181.1`	Pfam	`PF25780`	TPR_IPO5	Repeat	107	266	3.5e-10	41.1	IPO5-like, TPR repeats
`XP_057808181.1`	Pfam	`PF13513`	HEAT_EZ	Repeat	382	437	1.4e-22	80.4	HEAT-like repeat
`XP_057808181.1`	Pfam	`PF25574`	TPR_IMB1	Repeat	460	836	2e-112	376.4	Importin subunit beta-1-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952198.1
GGCAGTCCGGGCAGATTCGTGCCGTTGCCCGTCTTTTTATTTTCTCAGTTTTAGTGTGATTTTTTCTCCGCAAACTTCCCCTCCCGCTTATTCTCTCTATTCGAATTCATCTCTTTCACTCTCTCTCTCTCTGCTCATATTTCAAAAAAATTGCTTTCAAAAACTGATTCATAGTAGTATATAGAATTATAATTTATGCTACAGAGTAGATAATTTCATATCTGATCGAAGAGTTTTCTGGAACAAGCGTTAGAAGAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022687
ATGGCGTTAGAGATTACCCAGTATCTATTGGCTGCTCAATCTCCTGATGCGAAAATACGAAATGAGGCTGAGACTGCTCTTGGTCAGTTCCGTGAACAGAATTTACCTGGGTTTCTGCTCTCTTTATCGGTCGAACTCTCCAGTGATGGAAAGCCTACAGAGTCTCGGCGGCTTGCTGGTATTGTTCTCAAGAACTCCTTGGATGCTAAAGAAGCAGCAACCAAGGACAATCTTGTCCAACAGTGGGTGGCAATTGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808181.1
MALEITQYLLAAQSPDAKIRNEAETALGQFREQNLPGFLLSLSVELSSDGKPTESRRLAGIVLKNSLDAKEAATKDNLVQQWVAIDISFKSQIKNSLLNTLGSSVREVSHTAAQVVAKIASIEVPRKEWPELVGLLLANMTQPDRPALLKQATLEALGYVCEEISDEDLVQDEVNAVLTAVIQGMNVSEQNSDVRLAATRALYNALDFARTNFDNEMERNYIMKVICEAALANEIEIRKASFECLVSIASTYYEMLEPYM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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