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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000865`

染色体: Chr04 坐标: 10937929-10940892 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000865`
名称	SmilChr04G000865
描述	ferritin-3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10937929 - 10940892 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022696`
GeneID	`131022696`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022696`
原始查询	`LOC131022696`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferritin-3, chloroplastic-like
产物	ferritin-3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G40300` (FER4) ferritin 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818622] identity=70.3; qcov=0.871; evalue=3.87e-115; confidence=high
Rice	`Os12g0106000` (FER2) - identity=74.5; qcov=0.76; evalue=1.9e-105; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006826 (iron ion transport); GO:0006879 (intracellular iron ion homeostasis); GO:0006880 (GO:0006880); GO:0008198 (ferrous iron binding); GO:0008199 (ferric iron binding)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00210 (Ferritin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022696

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057808194.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057808194.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808194.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808194.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808194.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10938185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C23,C79
`Chr4:10939154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:10940411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A1,A2,A22,A25,A3,A5,B104,B110,B118,B124,B13,B130,B17,B19,B24,B32,B51,B54,B60,B7,B80,B81,B95,B97,C12,C24,C31,C36,C38,C4,C44,C54,C6,C61,C63,C64,C71,C73,C81,C85,C9,D1,D2,D6,D7,D9
`Chr4:10940517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:10940573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:10940576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr4:10940614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C58
`Chr4:10940617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C22
`Chr4:10940623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B11,B132,B20,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808194.1

263 aa

132

263

Ferritin

PF00210 Ferritin 100-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808194.1`	Pfam	`PF00210`	Ferritin	Domain	100	243	1.2e-33	116.7	Ferritin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952211.1
GGATCCCTTTTTCCTCCCTACGTGTCGCCCTCTCATTTGCCGGAGCCCCGCCGTATCGCAATTCGCCACTTCTATATAATCCCACCCACTCAACATTCAAACAAATCACACACTAATCACTACTCATCCCAAAATCTTAGCTTTTTCAGCCCCAAATCATTCTTCGTTGCTCCAGATTTCCCCATTTGATTGTTTTCGGATAAAAAAAAAGATGTTTCTGGAAGCAATTTCTGCTGTTTCTCTGCCTTCTGCTAGCCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022696
ATGTTTCTGGAAGCAATTTCTGCTGTTTCTCTGCCTTCTGCTAGCCTCGGACCACTGTCGAATGCTGCTGCTGCGACAACCTTTTCTTCTCCGAATTTGAGCTTCCGCGGTCTTGTTTCGGCGAAGAAGAGTGAAAATGGATTCGTGGCCAGCGCATCTTCGAACGACACGGTGACTATGCCGCTGGCTGGGGTGGTGTTTCATCCATTCGAGGAAGTTAAGAGAGATGAGCTCGTCGTCCCAATCGCTCCTGATGTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808194.1
MFLEAISAVSLPSASLGPLSNAAAATTFSSPNLSFRGLVSAKKSENGFVASASSNDTVTMPLAGVVFHPFEEVKRDELVVPIAPDVSIARQKFSQDCESAINEQINVEYCVSYVYHALYAYFDRDNVALKGLAKFFKEASEEEREHAEKLMEYQNKRGGRVKLFSLQMPPTEFDHVEKGDALHAMELALSLEKLTNEKLLKLHSVADASNDPQLADFVESEFLGEQVEAIKKISEYISQLRRVGKGHGVWHFDQMLLEGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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