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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000876`

染色体: Chr04 坐标: 11117400-11120160 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000876`
名称	SmilChr04G000876
描述	protein trichome birefringence-like 34
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11117400 - 11120160 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022699`
GeneID	`131022699`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022699`
原始查询	`LOC131022699`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 34
产物	protein trichome birefringence-like 34
Arabidopsis	`AT2G38320` (TBL34) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818412] identity=50.9; qcov=0.845; evalue=8.26e-130; confidence=high
Rice	`Os03g0817500` (OsTBL3) - identity=47.5; qcov=0.909; evalue=3.59e-127; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057808196.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808196.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808196.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808196.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11117925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr4:11118242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11118401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11118563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:11118575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B41
`Chr4:11118602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C18
`Chr4:11118677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C18
`Chr4:11118882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B73,C66
`Chr4:11118950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B133,B55,C17
`Chr4:11119573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:11119737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808196.1

419 aa

210

419

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 72-125 aa PF13839 PC-Esterase 126-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808196.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	72	125	7.4e-21	74.9	PMR5 N terminal Domain
`XP_057808196.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	126	414	2.4e-84	284.4	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101392.1
GTATCGTCCATTAATCATCTGATTATATATCGATACACTGTATAAACCGACACAATTAATTATTTAATTAATACAGAAATATATATATCCTTCATGTACTCTAATATAAAATCGCTCGTAAATTGTAAGAGAGGTGCTATGATTTTTTTTTTAACAAACGGTCATGTGTCTTTGACAGAGTGGAAGAGGTGATGATGAAGAATTCTTGGAGAAAAGGAACTAACATTCTTGCAAATAATGCAAGAAACCATGTGAAATTA...

XM_057952213.1
ATATTTGTATCGTCCATTAATCATCTGATTATATATCGATACACTGTATAAACCGACACAATTAATTATTTAATTAATACAGAAATATATATATCCTTCATGTACTCTAATATAAAATCGCTCGTAAATTGTAAGAGAGGTGCTATGATTTTTTTTTTAACAAACGGTCATGTGTCTTTGACAGAGTGGAAGAGGTGATGATGAAGAATTCTTGGAGAAAAGGAACTAACATTCTTGCAAATAATGCAAGAAACCATGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022699
ATGAAGCATGAAAAAATGAAAATGGGGATGGTCACTCACTGCATTCTTGGCTTCTCTCTCTTGATTTTAGTGGCCGCCGTTTTTTATCTCACGGGTGACTTCTTAGGCTTCTTGGATCTGCAGAGACAGCTCAAGAATGCGTGTAACGACGCCGGCAACGAGGCTCCGGCGTCGTACGAGGATAAGCCGAGTTCGAGTCTGAGTTCGAGCACGAGATGCAATTTGTTTGAAGGGAGATGGGTTTTTGACAATGTGTCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808196.1
MKHEKMKMGMVTHCILGFSLLILVAAVFYLTGDFLGFLDLQRQLKNACNDAGNEAPASYEDKPSSSLSSSTRCNLFEGRWVFDNVSLPLYEERNCSFMLPEFACERYGRKDFKYRNWRWQPRRCDLPRFNGTAFFEKIRGKKLVFVGDSLNRNQWTSMLCLVESALGPSSPRTVVRDENMHTFQSNEYNATIALYWSPFLVESNCDDPIIHRVKDRVVRLMGIDKHARHWNDADILIFNSYLWWTDPMTVTWGTSLGSSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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