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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000885`

染色体: Chr04 坐标: 11280501-11286761 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000885`
名称	SmilChr04G000885
描述	protein BREAST CANCER SUSCEPTIBILITY 2 homolog B-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11280501 - 11286761 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022710`
GeneID	`131022710`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022710`
原始查询	`LOC131022710`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein BREAST CANCER SUSCEPTIBILITY 2 homolog B-like
产物	protein BREAST CANCER SUSCEPTIBILITY 2 homolog B-like
Arabidopsis	`AT5G01630` (BRCA2B) BRCA2-like B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831710] identity=43.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os01g0164800` - identity=40.7; qcov=0.997; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	smil03440 (Homologous recombination - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00634 (BRCA2); PF09103 (BRCA-2_OB1); PF09169 (BRCA-2_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022710

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808208.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057808208.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057808208.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057808208.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11281029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr4:11281460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:11282279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C48
`Chr4:11282306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:11282480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11282514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B41
`Chr4:11282542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B83,C59
`Chr4:11283334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C82
`Chr4:11283334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:11284633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B52
`Chr4:11285074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:11285701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808208.1

1124 aa

562

1124

BRCA2

BRCA-2_helical

BRCA-2_OB1

PF00634 BRCA2 66-91 aa PF00634 BRCA2 142-169 aa PF00634 BRCA2 246-268 aa PF09169 BRCA-2_helical 526-597 aa PF09103 BRCA-2_OB1 601-726 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808208.1`	Pfam	`PF00634`	BRCA2	Family	66	91	8.3e-23	80.2	BRCA2 repeat
`XP_057808208.1`	Pfam	`PF00634`	BRCA2	Family	142	169	8.3e-23	80.2	BRCA2 repeat
`XP_057808208.1`	Pfam	`PF00634`	BRCA2	Family	246	268	8.3e-23	80.2	BRCA2 repeat
`XP_057808208.1`	Pfam	`PF09169`	BRCA-2_helical	Domain	526	597	1.1e-16	61.7	BRCA2, helical
`XP_057808208.1`	Pfam	`PF09103`	BRCA-2_OB1	Domain	601	726	1.4e-34	119.4	BRCA2, oligonucleotide/oligosaccharide-binding, domain 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952225.1
TCCGCATTCTTTTTTTTACTCCTCTCAAATTGGAATTGCAAAGGGCAGAACCCTAGGTGTCGCCTGAGAATGTCGACGTGGCGAATATTTTCCGGTGACCGGAACGATTTCCGGTGGGAAACCGCCGATCAACAGCTCCGCATTGAAGAATTCTCCGACGCTGTGGCTGAGGACACTCGTCGTCTCCCTTCCATGGCCGATCTACTGCTTCTAGGTTCTTCAAAGATATTGGAGAATGGGAGGAGAGATGTGGAGGAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022710
ATGTCGACGTGGCGAATATTTTCCGGTGACCGGAACGATTTCCGGTGGGAAACCGCCGATCAACAGCTCCGCATTGAAGAATTCTCCGACGCTGTGGCTGAGGACACTCGTCGTCTCCCTTCCATGGCCGATCTACTGCTTCTAGGTTCTTCAAAGATATTGGAGAATGGGAGGAGAGATGTGGAGGAGCAACCGACTTTTCGAACGGGATTGGGGAAATCTGTGGAGGTGAAGCAGTCGTCAATCGCGAGAGCACGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808208.1
MSTWRIFSGDRNDFRWETADQQLRIEEFSDAVAEDTRRLPSMADLLLLGSSKILENGRRDVEEQPTFRTGLGKSVEVKQSSIARARSVLGEVDYTLTDSGHSDGREKGFATFRPISNMNSMESAVMSTSAFHSASENVTQISNSMFQTGSGKTVNISSAGLLRAKALLGLDGTYDQEQTAKQSISTELLASDNPSHLETRKLGNFILSSSTRVLASSKVKSIPRASESMKFPKCMNAVSEPPQVKFQTAGGRSISVSSDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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