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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000897`

染色体: Chr04 坐标: 11541512-11547534 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000897`
名称	SmilChr04G000897
描述	protein SIEL
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11541512 - 11547534 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022722`
GeneID	`131022722`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022722`
原始查询	`LOC131022722`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SIEL
产物	protein SIEL
Arabidopsis	`AT3G08800` (SIEL) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820027] identity=36.3; qcov=0.978; evalue=1.1e-154; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0010496 (intercellular transport)
KEGG	-
Pfam	PF25458 (INTS4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022722

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808217.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057808217.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808218.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808218.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808218.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11541523`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B113
`Chr4:11541523`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B113
`Chr4:11541820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B41
`Chr4:11541874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr4:11541958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B41
`Chr4:11542257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B41
`Chr4:11543392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr4:11543430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr4:11543467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B5,D10
`Chr4:11543468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr4:11543807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B115,B130,B78,C74
`Chr4:11544672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808217.1

965 aa

482

965

INTS4_C

PF25458 INTS4_C 850-959 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808217.1`	Pfam	`PF25458`	INTS4_C	Domain	850	959	7.9e-08	33.0	Integrator subunit 4 family C-terminal Ig-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952235.1
CCCCAAGAAAAATGTGCATATCCGTCGGCCCAAAATATTCAGTTTTATTTTATAATTTCCGGCCCAAATACAAAATTAAAGAATTGGGCCCAAAATTCAAAATTGCAAAAGTAACGTCTTCTCCCCATCAACGTCCGCCGCTACTGATGGAGCAACGCCTCGTCGCCGCCGTCGGCCGGAACCCTAATCTCTCTCCTAAATCGTCAGTCGCCGTCCTCTCTCTCATCACCAACCCCTGCACGTCCGACTCAACTCTTACC...

XM_057952234.1
CCAAGAAAAATGTGCATATCCGTCGGCCCAAAATATTCAGTTTTATTTTATAATTTCCGGCCCAAATACAAAATTAAAGAATTGGGCCCAAAATTCAAAATTGCAAAAGTAACGTCTTCTCCCCATCAACGTCCGCCGCTACTGATGGAGCAACGCCTCGTCGCCGCCGTCGGCCGGAACCCTAATCTCTCTCCTAAATCGTCAGTCGCCGTCCTCTCTCTCATCACCAACCCCTGCACGTCCGACTCAACTCTTACCAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022722
ATGTGCATATCCGTCGGCCCAAAATATTCAGTTTTATTTTATAATTTCCGGCCCAAATACAAAATTAAAGAATTGGGCCCAAAATTCAAAATTGCAAAAGTAACGTCTTCTCCCCATCAACGTCCGCCGCTACTGATGGAGCAACGCCTCGTCGCCGCCGTCGGCCGGAACCCTAATCTCTCTCCTAAATCGTCAGTCGCCGTCCTCTCTCTCATCACCAACCCCTGCACGTCCGACTCAACTCTTACCACCATTGTAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808217.1
MCISVGPKYSVLFYNFRPKYKIKELGPKFKIAKVTSSPHQRPPLLMEQRLVAAVGRNPNLSPKSSVAVLSLITNPCTSDSTLTTIVETLNLHLQNPNSNHQQILSLLSALSDYHPRLRHRVGAAVHAFILLPSTPTSALPHALSFLNPADSTALDLFSDESLFLSLCFYECVKTRKWMLRNVSKFRMRPSVLLTVLLGFTKDPYPYIREAALDGLVMILNDGVVVEDRSLVGGCYFRAAELLFDADNSVRRSAVRAVSEW...

XP_057808218.1
MCISVGPKYSVLFYNFRPKYKIKELGPKFKIAKVTSSPHQRPPLLMEQRLVAAVGRNPNLSPKSSVAVLSLITNPCTSDSTLTTIVETLNLHLQNPNSNHQQILSLLSALSDYHPRLRHRVGAAVHAFILLPSTPTSALPHALSFLNPADSTALDLFSDESLFLSLCFYECVKTRKWMLRNVSKFRMRPSVLLTVLLGFTKDPYPYIREAALDGLVMILNDGVVVEDRSLVGGCYFRAAELLFDADNSVRRSAVRAVSEW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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