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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000900`

染色体: Chr04 坐标: 11623385-11626005 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000900`
名称	SmilChr04G000900
描述	patellin-6-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11623385 - 11626005 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022725`
GeneID	`131022725`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022725`
原始查询	`LOC131022725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	patellin-6-like
产物	patellin-6-like
Arabidopsis	`AT3G51670` (AT3G51670) SEC14 cytosolic factor family protein / phosphoglyceride transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824330] identity=70.7; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0429400` - identity=49.4; qcov=0.849; evalue=2.16e-113; confidence=high
GO	GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO); PF03765 (CRAL_TRIO_N); PF25099 (GOLD_PATL1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022725

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808220.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057808220.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808220.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808220.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808220.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11623542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr4:11623790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B5
`Chr4:11623802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr4:11624080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr4:11624787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:11624790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B52,B64,D11,D6
`Chr4:11624803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B48
`Chr4:11625584`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B136,C81
`Chr4:11625584`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B136,C81
`Chr4:11625603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B18,B54
`Chr4:11625629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr4:11625732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B41,B65,B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808220.1

405 aa

202

405

CRAL_TRIO_N

CRAL_TRIO

GOLD_PATL1_C

PF03765 CRAL_TRIO_N 46-99 aa PF00650 CRAL_TRIO 125-284 aa PF25099 GOLD_PATL1_C 305-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808220.1`	Pfam	`PF03765`	CRAL_TRIO_N	Domain	46	99	5.5e-11	43.2	CRAL/TRIO, N-terminal domain
`XP_057808220.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	125	284	5.2e-30	105.0	CRAL/TRIO domain
`XP_057808220.1`	Pfam	`PF25099`	GOLD_PATL1_C	Domain	305	389	1.1e-28	99.6	Patellin-1-like, C-terminal GOLD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952237.1
AAAATCAACACTTGACATTCAAACAAAACACACACACACACAAACTCATCATATCACCCACACTCTTACAAAACCAAAACCTCCTCTCTTCTTCCCCACTCCATCAATGGAGGCCCAAGCCCCCCCGAAGAAAACCTTCATCGCCGCCCTAATGTCGGCGGCGGCGTCCCCCCGCACCCCCTCGTACCGCGAAGACACCTACCTCCCCTCCCACCTGAAACCCTCGGAGCAGAAATCCCTCCAACACCTGAAGCAATCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022725
ATGGAGGCCCAAGCCCCCCCGAAGAAAACCTTCATCGCCGCCCTAATGTCGGCGGCGGCGTCCCCCCGCACCCCCTCGTACCGCGAAGACACCTACCTCCCCTCCCACCTGAAACCCTCGGAGCAGAAATCCCTCCAACACCTGAAGCAATCCCTCCTGGCCTCCTCCCCCACCCCCCACCCCTCCATGTGGGGCATCCCCCTCCTCCCCCCCGACGCCGACCCCCGCGGCGACGTCGTCCTCCTCAAGTTCCTCCGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808220.1
MEAQAPPKKTFIAALMSAAASPRTPSYREDTYLPSHLKPSEQKSLQHLKQSLLASSPTPHPSMWGIPLLPPDADPRGDVVLLKFLRARDFRPRDAADMLLRCLEWRRAFAADAVAEEDLGFKELEGVVAYMRGLDRGGRPVCYNAYGVFKDKEMYERIFGDEEKLGRFLRWRVQILERGMKLLDFKPGGVNSIIQVTDLKDMPKRELRAASNHILSLFQDNYPEMVARKIFINVPWYFSLLYSMFSPFLTQRTKTKFLIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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