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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000912`

染色体: Chr04 坐标: 11858716-11865434 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000912`
名称	SmilChr04G000912
描述	SCAR-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11858716 - 11865434 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022736`
GeneID	`131022736`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022736`
原始查询	`LOC131022736`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SCAR-like protein 1
产物	SCAR-like protein 1
Arabidopsis	`AT2G38440` (SCAR2) SCAR homolog 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818425] identity=46.8; qcov=0.328; evalue=3.73e-111; confidence=low
Rice	`Os03g0816900` (OsSCAR3) - identity=37.6; qcov=0.311; evalue=6.71e-68; confidence=low
GO	GO:0005856 (cytoskeleton); GO:0030036 (actin cytoskeleton organization); GO:0034237 (protein kinase A regulatory subunit binding); GO:0071933 (Arp2/3 complex binding); GO:2000601 (positive regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation)
KEGG	-
Pfam	PF27569 (SCAR_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022736

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057808237.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808237.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808237.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808237.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808237.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11859142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B65,B77
`Chr4:11859238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr4:11859435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11859924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr4:11859967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:11860101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:11860454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C19,C54
`Chr4:11860710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11860915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11861551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11861853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11862007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808237.1

1445 aa

722

1445

SCAR_helical

PF27569 SCAR_helical 4-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808237.1`	Pfam	`PF27569`	SCAR_helical	Domain	4	188	3.5e-71	239.5	SCAR helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952254.1
TTTTCAAGTCCTCAGTAGCGCAGCATAATCACAAAAAAAAGTAAATAAAACAGAAAACCTCTCTGTCTCTATCTATCTATATACATATAGCATTTATATGTATCGGTGGTGGTTGGAGGTGGTGAGCCTCAAAGTTGAGAAATTGATCGAGTTCGGTTGAGTTTTTTGATTCTCGAAAGCAGAGGAGAAAATGCCGATGACGAGATACGAGATACGGAATGAGTATAGTTTGGCCGATCCCGAGCTGTATCGAGCGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022736
ATGCCGATGACGAGATACGAGATACGGAATGAGTATAGTTTGGCCGATCCCGAGCTGTATCGAGCGGCGGATAAGGATGATCCGGAGGCCTTGCTTGAAGGCGTCGCCATGGCCGGTTTGGTCGGAGTTCTTCGCCAGCTCGGCGACCTAGCCGAGTTTGCTGCAGAGATTTTTCATAACCTACACGAGGATATGATGGCAACTGCTTCAAGGGGGCATGCCTTAGCATTTCGGGTTCAACAACTTGAGATAGAGATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808237.1
MPMTRYEIRNEYSLADPELYRAADKDDPEALLEGVAMAGLVGVLRQLGDLAEFAAEIFHNLHEDMMATASRGHALAFRVQQLEIEIPAVERAFLSQTDHSSFFYHPGVDWHPNLRLDNNLVTREDMPRFIMDSYEECREPPRLFLLDKFDIAGAGACLKRYTDPSFFKVESSEVTSADIQREKKIRKVKKKGPRWRNRETHEVVPTSHAKLHQLFLEERVENGINSASLGAKLKRRLNGFPFNSKTGKSYMEKILKSPSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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