当前解析结果
SmilChr04G000924| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000924 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000924 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000924 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 12068785 - 12071173 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022749 |
|---|---|
| GeneID | 131022749 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022749 |
| 原始查询 | LOC131022749 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | late embryosis abundant protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836811]; symbol=AT5G66780; hit=AT5G66780; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | late embryosis abundant protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836811]; symbol=AT5G66780; hit=AT5G66780; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G66780 (AT5G66780)late embryosis abundant protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836811] identity=45; qcov=0.992; evalue=2.01e-21; confidence=medium |
| Rice | Os03g0723400 (OsEnS-53)- identity=55.4; qcov=0.5; evalue=2.56e-13; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022749 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057808254.1 |
| 2 | Mitochondrion matrix | 线粒体基质 | 0.40000 | XP_057808254.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808254.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808254.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808254.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:12070575 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A13,B41,C13 |
Chr4:12070581 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:12070937 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C15 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。