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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000926`

染色体: Chr04 坐标: 12078221-12079121 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000926`
名称	SmilChr04G000926
描述	uncharacterized SmilChr04G000926
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12078221 - 12079121 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022751`
GeneID	`131022751`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022751`
原始查询	`LOC131022751`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homolog of X-ray repair cross complementing 3 (XRCC3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835850]; symbol=XRCC3; hit=AT5G57450; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	homolog of X-ray repair cross complementing 3 (XRCC3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835850]; symbol=XRCC3; hit=AT5G57450; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G57450` (XRCC3) homolog of X-ray repair cross complementing 3 (XRCC3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835850] identity=53.2; qcov=0.681; evalue=3.32e-23; confidence=medium
Rice	`Os01g0578000` (RAD51C) - identity=40.8; qcov=0.673; evalue=7.71e-15; confidence=low
GO	GO:0000400 (four-way junction DNA binding); GO:0000722 (telomere maintenance via recombination); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005657 (replication fork); GO:0033065 (Rad51C-XRCC3 complex); GO:0045003 (double-strand break repair via synthesis-dependent strand annealing); GO:0071140 (resolution of mitotic recombination intermediates); GO:0090656 (t-circle formation); GO:0140664 (ATP-dependent DNA damage sensor activity)
KEGG	-
Pfam	PF08423 (Rad51)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022751

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808256.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808256.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808256.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808256.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808256.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12078785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr4:12078848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C68,C81
`Chr4:12078865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C68,C81
`Chr4:12078914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C37
`Chr4:12078937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B108,B27,C43
`Chr4:12078941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,C32,C63,C68
`Chr4:12078944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,C32,C63,C68
`Chr4:12078952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C32,C68
`Chr4:12078963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C32,C68
`Chr4:12078964`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B72,C32,C68
`Chr4:12078964`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B72,C32,C68
`Chr4:12078967`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B72,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808256.1

113 aa

113

Rad51

PF08423 Rad51 23-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808256.1`	Pfam	`PF08423`	Rad51	Domain	23	100	1.9e-14	54.2	Rad51

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952273.1
GGTGAACGCAAGAGATTTGATACTGTTAGCAATGGATGCTTCTGGCAATAGAATTCTTTCTCCATCCTTCACTCCACTTTCATCTATTCCTACTCAAAAAATCACGTTCGGATGTCCAGTAATTGATTGTTTGTTTGGTGGTGGTTTGTGCTTGAGGACTCTTACCGAGGTTGTAGGCGAGAGCGGAACGGGAAAAACACAAATTGCCCTTCAGTTAGCTCTAAATGTTCAATTACCTATAGTGCATGGTGGTCTTGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022751
ATGGATGCTTCTGGCAATAGAATTCTTTCTCCATCCTTCACTCCACTTTCATCTATTCCTACTCAAAAAATCACGTTCGGATGTCCAGTAATTGATTGTTTGTTTGGTGGTGGTTTGTGCTTGAGGACTCTTACCGAGGTTGTAGGCGAGAGCGGAACGGGAAAAACACAAATTGCCCTTCAGTTAGCTCTAAATGTTCAATTACCTATAGTGCATGGTGGTCTTGATGCTTCCGCGTTATACATTTACACTGATTTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808256.1
MDASGNRILSPSFTPLSSIPTQKITFGCPVIDCLFGGGLCLRTLTEVVGESGTGKTQIALQLALNVQLPIVHGGLDASALYIYTDFSFPIKRLKQLSLRIPNLPRNALDKGAI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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