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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000944`

染色体: Chr04 坐标: 12498844-12502934 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000944`
名称	SmilChr04G000944
描述	TOM1-like protein 6
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12498844 - 12502934 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022764`
GeneID	`131022764`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022764`
原始查询	`LOC131022764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TOM1-like protein 6
产物	TOM1-like protein 6
Arabidopsis	`AT2G38410` (AT2G38410) ENTH/VHS/GAT family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818422] identity=54.1; qcov=0.707; evalue=1.57e-128; confidence=high
Rice	`Os05g0475300` - identity=42.6; qcov=1.06; evalue=8.57e-138; confidence=medium
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0043328 (protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00790 (VHS); PF03127 (GAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022764

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057808268.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808268.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057808268.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057808268.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057808268.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12501211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:12501361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:12501388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:12501657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:12501676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B54
`Chr4:12501753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:12501775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B81,C6,C67
`Chr4:12501781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:12501939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B82,C79,C81
`Chr4:12501952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr4:12502016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:12502123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B84,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808268.1

610 aa

305

610

VHS

GAT

PF00790 VHS 8-122 aa PF03127 GAT 204-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808268.1`	Pfam	`PF00790`	VHS	Repeat	8	122	5e-35	121.1	VHS domain
`XP_057808268.1`	Pfam	`PF03127`	GAT	Domain	204	277	8.6e-18	65.0	GAT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952285.1
GTAACGTTTAGAAAAACTCAAGAGGAGAGAGAGAGACTAAAATAAAGGAGTGTTAGAGAGAGAGTAGAGAGTCTGTTTGGCGGCGAGTGCAACACGGCGGAACACAAGAGCGCGTGTGAGCAACGCTTTCTGCAGAAATAAAAGGGAATTTTAATACAATGGAATCCCAAAGCGATAAAAACCAAATTTCCTAAAAATCAATACCATAGCCATGTAAAAGTTAGCCCAAAATCAGTTAATAGCTTTAAATTATTTAGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022764
ATGATTTCATCAATAGCTTCGTCTTCTTCGGCTACTGTGAGAGTCGAGAAAGCTACGAGCGAGTTCTTGATCGGACCCGATTGGACGCTCAATATGGAAATTTGTGATATCGTTAATTCCAATCAGATGCTTGCAAAAGATGTTGTGAAAGCTGTGAAGAAACGGTTGCAGCACAAGAACCCCAAAGTTCAATTGCTTGCTTTAACGCTTCTGGAGACGATTGTCAAGAACTGCGGCGATTATGTTCATTTTCAGATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808268.1
MISSIASSSSATVRVEKATSEFLIGPDWTLNMEICDIVNSNQMLAKDVVKAVKKRLQHKNPKVQLLALTLLETIVKNCGDYVHFQIAEKNILPEMVKIVKKKTDMHVRDKILTLVGSWHEAFGGSGGRYPQYYMAYEDLRRFGVQFPRRTPDAAPIFTPPAAHAVSTPPPGYGMPSSSSTRLDHAMAAEDTLSLSSLNSMRDVLELLRDMLQAVDPSDRSAVNDEIIVDLVEQCRVNQRKLMQLLGTTGDEEVLVKGLDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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