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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000946`

染色体: Chr04 坐标: 12527019-12530192 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000946`
名称	SmilChr04G000946
描述	alanine--glyoxylate aminotransferase 2 homolog 3, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12527019 - 12530192 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022766`
GeneID	`131022766`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022766`
原始查询	`LOC131022766`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alanine--glyoxylate aminotransferase 2 homolog 3, mitochondrial-like
产物	alanine--glyoxylate aminotransferase 2 homolog 3%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G08860` (PYD4) PYRIMIDINE 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820034] identity=73.8; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0338000` - identity=77.2; qcov=0.956; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0008483 (transaminase activity); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00250 (Alanine, aspartate and glutamate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00260 (Glycine, serine and threonine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00280 (Valine, leucine and isoleucine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00202 (Aminotran_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022766

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057808270.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057808270.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808270.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808270.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808270.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12528017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:12528021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:12528052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D8
`Chr4:12528052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr4:12528507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr4:12528660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr4:12528780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B63
`Chr4:12530000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B16,B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808270.1

478 aa

239

478

Aminotran_3

PF00202 Aminotran_3 81-473 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808270.1`	Pfam	`PF00202`	Aminotran_3	Domain	81	473	1.1e-93	314.9	Aminotransferase class-III

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952287.1
CCAACTCATACATCCGTAACACTCTCTCTCTCTCTCTCTTATATATATATACGTGCAGAGATTTCTTTGTAAACATTAATGATGAAAGGAGTTGCAGTGAGAAGGGCATTATGGGAATCCAAACTTTTCCGAGGCAGCGGGAGACGTGGGTATTCCCGCAGCGCCGGTGCATGCTCCGCCGCGGACGTGAACGAACTCCCGAAAATACCCCCCTTCGACTACACTCCGCCGCCGTACTCGGGCCCCACCGCCGCCGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022766
ATGATGAAAGGAGTTGCAGTGAGAAGGGCATTATGGGAATCCAAACTTTTCCGAGGCAGCGGGAGACGTGGGTATTCCCGCAGCGCCGGTGCATGCTCCGCCGCGGACGTGAACGAACTCCCGAAAATACCCCCCTTCGACTACACTCCGCCGCCGTACTCGGGCCCCACCGCCGCCGAGATCTTGGCCAAGCGGAAAGAATTCCTCAGCCCTTCCATGTTCCCCTTCTACACTAAACCTGTGAACATAGTCCATGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808270.1
MMKGVAVRRALWESKLFRGSGRRGYSRSAGACSAADVNELPKIPPFDYTPPPYSGPTAAEILAKRKEFLSPSMFPFYTKPVNIVHGKMQYLFDEKGRRYLDGFGGIATVCCGHCHPDVVKAIIDQTNNLQHSTILYLNHAIADFAEALASKLPGDLKVVFFTNSGTEANELAMMMARLYTGSHDIVSLRNAYHGNAAGTMGATAQSNWKFNVVQSGVHHALNPDPYRGMFGSDGEKYARDVEDLIKFGTSGRVAGFMSEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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