当前解析结果
SmilChr04G001291| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001291 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001291 |
| 描述 | KH domain-containing protein HEN4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 20574153 - 20576371 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022797 |
|---|---|
| GeneID | 131022797 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022797 |
| 原始查询 | LOC131022797 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | KH domain-containing protein HEN4-like |
| 产物 | KH domain-containing protein HEN4-like |
| Arabidopsis | AT5G64390 (HEN4)RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836560] identity=41.9; qcov=0.959; evalue=5.49e-20; confidence=low |
| Rice | Os09g0498600- identity=44.1; qcov=0.959; evalue=7.63e-22; confidence=medium |
| GO | GO:0003723 (RNA binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00013 (KH_1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022797 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808305.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057808305.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808305.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808305.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808305.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808305.1PF00013
KH_1 42-89 aa
XP_057808306.1PF00013
KH_1 42-91 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808305.1 |
Pfam | PF00013 |
KH_1 | Domain | 42 | 89 | 8.8e-09 | 35.7 | KH domain |
XP_057808306.1 |
Pfam | PF00013 |
KH_1 | Domain | 42 | 91 | 6.1e-09 | 36.2 | KH domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。