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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003207`

染色体: Chr04 坐标: 48927984-48930704 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003207`
名称	SmilChr04G003207
描述	thiosulfate sulfurtransferase 16, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48927984 - 48930704 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022803`
GeneID	`131022803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022803`
原始查询	`LOC131022803`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thiosulfate sulfurtransferase 16, chloroplastic-like
产物	thiosulfate sulfurtransferase 16%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G66040` (STR16) sulfurtransferase protein 16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836734] identity=60.5; qcov=0.669; evalue=7.16e-52; confidence=high
Rice	`Os06g0725000` (OsStr9) - identity=69.9; qcov=0.635; evalue=1.96e-55; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00581 (Rhodanese)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057808311.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057808310.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057808311.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808310.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808310.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48928633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B51,C20,C50,C55,C59
`Chr4:48930343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr4:48930392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B67,C82
`Chr4:48930400`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B114
`Chr4:48930400`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B114
`Chr4:48930403`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B114
`Chr4:48930403`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B114
`Chr4:48930583`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B14
`Chr4:48930583`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808310.1

179 aa

179

Rhodanese

PF00581 Rhodanese 77-172 aa

XP_057808311.1

178 aa

178

Rhodanese

PF00581 Rhodanese 76-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808310.1`	Pfam	`PF00581`	Rhodanese	Domain	77	172	1.7e-16	61.2	Rhodanese-like domain
`XP_057808311.1`	Pfam	`PF00581`	Rhodanese	Domain	76	171	1.6e-16	61.3	Rhodanese-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952328.1
CAACTCCATATATACTTCCCATGCCACAAGCCATACATAATACAATCATATGTTCATATCTCCTTTGCCTCTAAAAACCAAAGAAAGAAGCAAATGAGCTCCATCTCTCCATTTTCTGCTGCCTTACTTCCTCTGAATCTTCCCCAAGATGCAAATACTAGGTGTGCATCTCTAAAGGTGATCAAGAATCAGCTTGGGCCGATCGTACGACGTAGTTTTAGCACCAGCCGCCGAGTTCCCGGCTTCAGGATGGTAGCAGA...

XM_057952327.1
AACTCCATATATACTTCCCATGCCACAAGCCATACATAATACAATCATATGTTCATATCTCCTTTGCCTCTAAAAACCAAAGAAAGAAGCAAATGAGCTCCATCTCTCCATTTTCTGCTGCCTTACTTCCTCTGAATCTTCCCCAAGATGCAAATACTAGGTGTGCATCTCTAAAGGTGATCAAGAATCAGCTTGGGCCGATCGTACGACGTAGTTTTAGCACCAGCCGCCGAGTTCCCGGCTTCAGTGGGATGGTAGCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022803
ATGAGCTCCATCTCTCCATTTTCTGCTGCCTTACTTCCTCTGAATCTTCCCCAAGATGCAAATACTAGGTGTGCATCTCTAAAGGTGATCAAGAATCAGCTTGGGCCGATCGTACGACGTAGTTTTAGCACCAGCCGCCGAGTTCCCGGCTTCAGTGGGATGGTAGCAGAGAGCGGGAATGCGCAATCACCTGCTGTCCCAACATCGGTCCCTGTTCGTGTCGCAAATGAACTACTTCAAGCCGGTCATCGTTATCTGGA...

LOC131022803
ATGAGCTCCATCTCTCCATTTTCTGCTGCCTTACTTCCTCTGAATCTTCCCCAAGATGCAAATACTAGGTGTGCATCTCTAAAGGTGATCAAGAATCAGCTTGGGCCGATCGTACGACGTAGTTTTAGCACCAGCCGCCGAGTTCCCGGCTTCAGGATGGTAGCAGAGAGCGGGAATGCGCAATCACCTGCTGTCCCAACATCGGTCCCTGTTCGTGTCGCAAATGAACTACTTCAAGCCGGTCATCGTTATCTGGATGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808310.1
MSSISPFSAALLPLNLPQDANTRCASLKVIKNQLGPIVRRSFSTSRRVPGFSGMVAESGNAQSPAVPTSVPVRVANELLQAGHRYLDVRTTEEFSAGHVVGAVNVPFMLRRGTGMARNPKFLEEVSTHFSKDDEIIVGCQLGKRSLMAASELVSAGFTGITDMAGGYAAWVQNGLPSTA

XP_057808311.1
MSSISPFSAALLPLNLPQDANTRCASLKVIKNQLGPIVRRSFSTSRRVPGFRMVAESGNAQSPAVPTSVPVRVANELLQAGHRYLDVRTTEEFSAGHVVGAVNVPFMLRRGTGMARNPKFLEEVSTHFSKDDEIIVGCQLGKRSLMAASELVSAGFTGITDMAGGYAAWVQNGLPSTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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