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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000002`

染色体: Chr04 坐标: 61644-63020 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000002`
名称	SmilChr04G000002
描述	nucleoside diphosphate kinase 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	61644 - 63020 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022810`
GeneID	`131022810`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022810`
原始查询	`LOC131022810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleoside diphosphate kinase 1
产物	nucleoside diphosphate kinase 1
Arabidopsis	`AT4G09320` (NDPK1) nucleoside diphosphate kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826515] identity=80.4; qcov=0.751; evalue=2.94e-89; confidence=high
Rice	`Os10g0563700` - identity=78.4; qcov=0.751; evalue=2.17e-89; confidence=high
GO	GO:0004550 (nucleoside diphosphate kinase activity); GO:0006183 (GTP biosynthetic process); GO:0006228 (UTP biosynthetic process); GO:0006241 (CTP biosynthetic process)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00334 (NDK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022810

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808317.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808317.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057808317.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808317.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808317.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:61933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,C3,C57,C62,C64
`Chr4:62758`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	82	A1,A18,A20,A22,A23,A24,A4,A9,B1,B108,B11,B112,B117,B118,B119,B120,B127,B128,B132,B136,B138,B17,B18,B19,B22,B25,B27,B28,B29,B3,B33,B36,B44,B45,B49,B54,B6,B67,B68,B69,B7,B75,B76,B78,B83,B87,B91,B95,B97,C1,C15,C17,C18,C20,C22,C23,C24,C26,C27,C31,C36,C40,C44,C54,C55,C56,C57,C58,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C70,C71,C76,C77,C79,C82,C86,D6
`Chr4:62765`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A14,A25,A3,A5,B1,B134,B4,B54,B60,B62,C45,C6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808317.1

197 aa

197

NDK

PF00334 NDK 51-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808317.1`	Pfam	`PF00334`	NDK	Domain	51	182	1.5e-57	193.9	Nucleoside diphosphate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952334.1
TATGCGAGTTGGTTTGTTGGACCATTGTCCAAAATTTTGAGAATATTCAAAGCAAATTTTAAGGCAAAAGTTATACTCCTCTTTTCCTTTCCTACAAAGAAAGGCGAAACCTTTTATCAACTGACGAATAAAATAAACAAAACCAAAAATAAAAATTGGCGCTCGATAGAATATTCCAAAGCAAATGGTGTCTAGGGTTTGTGCGCTCACCACATTCTCGTCTCGTGCGGTATATCTATCTCTCTCTCTCTATATATATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022810
ATGGTGTCTAGGGTTTGTGCGCTCACCACATTCTCGTCTCGTGCGGTATATCTATCTCTCTCTCTCTATATATATATACATACACACCGCTTGATTCGAACGCTTCACACCTTCACTTCAATTGCAAACCAATACCCTTGGGCGAAAATGGAGAAGACCTTCATTATGATCAAGCCTGATGGTGTTCAAAGGAACCTGGTTGGTGAGATTATTGGCAGGTTTGAGAAGAAGGGTTTCACTTTGAAAGGGTTGAAGTTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808317.1
MVSRVCALTTFSSRAVYLSLSLYIYIHTHRLIRTLHTFTSIANQYPWAKMEKTFIMIKPDGVQRNLVGEIIGRFEKKGFTLKGLKFVSVDRAFAEKHYADLSAKPFFNGLVEYIISGPVVAMVWEGKNVVTTGRKIIGATNPAESAPGTIRGDYAIDIGRNVIHGSDAVESARKEIALWFPEGIAEWRSSLHSWIYE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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