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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000005`

染色体: Chr04 坐标: 80344-83145 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000005`
名称	SmilChr04G000005
描述	RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	80344 - 83145 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022813`
GeneID	`131022813`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022813`
原始查询	`LOC131022813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like
产物	RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like
Arabidopsis	`AT4G17520` (AT4G17520) Hyaluronan / mRNA binding family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827467] identity=49.3; qcov=1.06; evalue=3.61e-82; confidence=high
Rice	`Os01g0721900` (P0690B02.26-1) - identity=52.1; qcov=1.08; evalue=2.87e-60; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF04774 (HABP4_PAI-RBP1); PF09598 (Stm1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022813

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808321.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808321.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057808321.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057808321.1`
5	Stress granule	Stress granule	0.20000	`XP_057808321.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:80613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr4:80634`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B102,B50,B65,B66,B71,B72,B89,C41,C43,C62
`Chr4:80635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:80672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr4:81035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B24,B62,C51
`Chr4:81604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B137,C52
`Chr4:81714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C68,C82
`Chr4:82106`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr4:82106`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr4:82144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:82786`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A24,A9,B107,B111,B130,B132,B139,B22,B35,B88,B93,C1,C17,C23,C56,C9
`Chr4:82817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808321.1

358 aa

179

358

Stm1_N

HABP4_PAI-RBP1

PF09598 Stm1_N 1-69 aa PF04774 HABP4_PAI-RBP1 149-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808321.1`	Pfam	`PF09598`	Stm1_N	Family	1	69	1.3e-20	74.6	Stm1
`XP_057808321.1`	Pfam	`PF04774`	HABP4_PAI-RBP1	Family	149	255	1.2e-25	91.1	Hyaluronan / mRNA binding family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952338.1
ATATAAATAAAAACATTTACGTATATAACAGTCACCGCACTGTGTTTAGATAAACCTCACTCTATACTCACTGTTGATTGCGGCTAGGGTTTGGCTCTCTCTTTATCTCTCTCCCTTTCAACTCATTCTCTCTCACCTCTCCTTCCGTCCTTTCAAGACTCTTAGATCTGTTGATTCTGATACACTCAATAATGAATACAAGGTTAAATTAAAGGATTAGTTATCAATAATCTTAAAGACAGGGTTTTGGTTTTGGTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022813
ATGGCGACGCTAAACCCATTCGATTTGCTGGGCGACGATACGGAGGACCCCTCGCTGCTTGCAGCTCAGCAGCAGAAGATCGAGCCCAAAAAAAGCGTTGCACCACCGACCAAGCAGCCAGCGCAGCCGAAGCTCCCCTCCAAGCCGCTGCCCCCGGCTCAGGCTGTAAGAGAGGCAAAATTTGATTCTGCTCGAGGTGGACGTGGTCGAGGGCGTGGAAATGCTCGTGGTGCTGGTGTGGGCCCCAATAGAGACTTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808321.1
MATLNPFDLLGDDTEDPSLLAAQQQKIEPKKSVAPPTKQPAQPKLPSKPLPPAQAVREAKFDSARGGRGRGRGNARGAGVGPNRDFANNENSYGNKEVFAPQGAPDEVDGKPSERRGGGYGGPRGSFRGGRRGGFSNGDAGEGERDRIRRPLERRSGTGRGTEMKREGAGRGNWGMQTDELAQVTEEVVNEDDKNLNLEKPSGEEDAAENVEKEATKDENEEKPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLALKSEERKVDAKEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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