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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000012`

染色体: Chr04 坐标: 191754-195795 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000012`
名称	SmilChr04G000012
描述	COP9 signalosome complex subunit 7-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	191754 - 195795 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022823`
GeneID	`131022823`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022823`
原始查询	`LOC131022823`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COP9 signalosome complex subunit 7-like
产物	COP9 signalosome complex subunit 7-like
Arabidopsis	`AT1G02090` (FUS5) Proteasome component (PCI) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839241] identity=76.7; qcov=0.907; evalue=8.09e-128; confidence=high
Rice	`Os07g0490800` - identity=69.1; qcov=0.5; evalue=4.87e-54; confidence=medium
GO	GO:0008180 (COP9 signalosome)
KEGG	-
Pfam	PF01399 (PCI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022823

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808332.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057808333.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808332.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808332.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808332.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:193385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B42,B43,C30
`Chr4:193388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A21,B113,B50,B51,B78,B93,C18,C60
`Chr4:193393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr4:194035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr4:194484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,B54
`Chr4:194782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:194825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B108,B60,C45,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808332.1

260 aa

130

260

PCI

PF01399 PCI 82-155 aa

XP_057808333.1

247 aa

124

247

PCI

PF01399 PCI 82-155 aa

XP_057808334.1

246 aa

123

246

PCI

PF01399 PCI 82-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808332.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	82	155	1e-08	36.0	PCI domain
`XP_057808333.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	82	155	1e-08	36.0	PCI domain
`XP_057808334.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	82	155	1e-08	36.0	PCI domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952349.1
TGTTAATTTCTCATAATTTTAAGGGGCCAAATTGGGATTTCTTAGAGAGAGAGAGAATTCGAAAAACCAGACCTCTCTCTCAAATGAGAAAAACCCTTCCCATAATTTATCTGATGAAGAAAGGGGAAAATTTTCTAAAAAATTAATACTCTCTAAATCCCTAAACCCTTATCGCGATCAATTAAACCCTTCGGCGAATATATGCAGTGGCAACTTCACCGACACAAGGGCGATTAGTACGAGCAAAATTCTATGCGATT...

XM_057952350.1
GGGATTTCTTAGAGAGAGAGAGAATTCGAAAAACCAGACCTCTCTCTCAAATGAGAAAAACCCTTCCCATAATTTATCTGATGAAGAAAGGGGAAAATTTTCTAAAAAATTAATACTCTCTAAATCCCTAAACCCTTATCGCGATCAATTAAACCCTTCGGCGAATATATGCAGTGGCAACTTCACCGACACAAGGGCGATTAGTACGAGCAAAATTCTATGCGATTTCGCAATCTTCTGTCGCATCCGTAGAAATTTGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131022823
ATGGACATTGAGCAACAGCAAGCTGAGCACATTGACTACTTCTTGAAGAAGGCGTCGACTCTCAAGGACTCGGCGCTGTCGAACGTCGTCGTAGAGGCAACTTCGCATCCTTCCCTCTTTGCTTTCTCCGAGATTCTCGCCGTCCCTAACGTCATAGAGCTAGAAGGGACTGAGAATAGTGCCTTCCTTGACGTGCTTCGCATGTTTGCGTATGGTACATGGAGTGAATATAAGATTGCTGCTAGTCGTCTTCCACAATT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057808332.1
MDIEQQQAEHIDYFLKKASTLKDSALSNVVVEATSHPSLFAFSEILAVPNVIELEGTENSAFLDVLRMFAYGTWSEYKIAASRLPQLVPDQVLKLKQLTVLTLAETNKVLPYDSLMQELDVSNVRELEDFLINDCMYVGIVRGKLDQLKRCFEVQFAAGRDLRPGQLGGMIQTLSNWLCTSENLLVSIQEKIKWGDAMSEIDKKHEKEVEERVEEVKKTLSIKADIDFRGHEEIFSEHGGVIMDFEEDRSRPKRRRHPIG

XP_057808333.1
MDIEQQQAEHIDYFLKKASTLKDSALSNVVVEATSHPSLFAFSEILAVPNVIELEGTENSAFLDVLRMFAYGTWSEYKIAASRLPQLVPDQVLKLKQLTVLTLAETNKVLPYDSLMQELDVSNVRELEDFLINDCMYVGIVRGKLDQLKRCFEVQFAAGRDLRPGQLGGMIQTLSNWLCTSENLLVSIQEKIKWGDAMSEIDKKHEKEVEERVEEVKKTLSIKKLPIVSRPTLTSEGMRRSFLNMVE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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