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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000040`

染色体: Chr04 坐标: 388457-389775 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000040`
名称	SmilChr04G000040
描述	ethylene-responsive transcription factor ERF034-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	388457 - 389775 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022854`
GeneID	`131022854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022854`
原始查询	`LOC131022854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor ERF034-like
产物	ethylene-responsive transcription factor ERF034-like
Arabidopsis	`AT2G44940` (AT2G44940) Integrase-type DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819103] identity=53.3; qcov=0.657; evalue=2.86e-61; confidence=high
Rice	`Os02g0656600` (OsERF#032) - identity=80.7; qcov=0.274; evalue=5.91e-43; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808382.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808382.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808382.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808382.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808382.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:388753`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	117	A10,A13,A15,A16,A18,A22,A24,A5,A6,A7,A8,B1,B101,B102,B108,B112,B115,B118,B119,B123,B129,B132,B133,B137,B138,B14,B17,B18,B19,B2,B21,B23,B28,B30,B33,B34,B36,B38,B39,B40,B46,B5,B53,B56,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B73,B76,B77,B78,B79,B81,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B96,C1,C10,C13,C15,C16,C18,C19,C22,C24,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C35,C36,C41,C43,C44,C46,C47,C51,C53,C54,C55,C59,C60,C61,C63,C64,C66,C68,C70,C72,C77,C78,C79,C8,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D11,D6
`Chr4:388896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C78
`Chr4:388951`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C85
`Chr4:388951`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C85
`Chr4:389073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:389326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr4:389361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808382.1

303 aa

152

303

AP2

PF00847 AP2 140-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808382.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	140	189	8.4e-16	58.7	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952399.1
GGTAATTTTAACACGTACGTCTCTACATTTGTACGTAGGTCGGTATATGACTTATCGACTATTACACTATGCACCAAATAAATTTACATTGACTCAAATCTATTCTAATACTTTAAAGGCTTTTAAGGGTACGATAGCTCAATTTTTATAATATCCCTCACCTTGAGCATAATTAAATGTTGTGTATGGTGTGTTGGTTATCTTTTTCTTTATATAAATTAATCCAAATTGTGAAAGAATCTTATATTTGCCCAAACTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022854
ATGTTGTGTATGGTGTGTTGGTTATCTTTTTCTTTATATAAATTAATCCAAATTGTGAAAGAATCTTATATTTGCCCAAACTCCCCTACTTTATGTAGCAACATTACACATTCTCTCACTCAGCTAGCTACTAGCCCACAAGGCATGGAACACAAAATCATCTTTGAGAATATAGTTGAAGACCAACTTTTCTCCACCTCCACCTCCACCTCCTCCTCCACCTCAACCACCACCGCCGCCGCCGCCACATCCACGTCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808382.1
MLCMVCWLSFSLYKLIQIVKESYICPNSPTLCSNITHSLTQLATSPQGMEHKIIFENIVEDQLFSTSTSTSSSTSTTTAAAATSTSSSSSNETQSAATTCDKSNIEAKSQGEKSGNEVSKRRKAAASGGGGGGCGDRHPTYRGVRKRNWGKWVCEIREPRKKSRIWLGTYPTAEMAARAHDVAALAIKGQSAYLNFPHLAQVLPRPASTAPKDIQAAAAKAAAATFPGEAEPSRSQLVSSHSSTDLAADSMQESADDTFF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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